Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z442

PKD1L2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1L2Q7Z442 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKD1L2Q7Z442 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKD1L2Q7Z442 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKD1L2Q7Z442 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKD1L2Q7Z442 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD1L2Q7Z442 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD1L2Q7Z442 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKD1L2Q7Z442 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKD1L2Q7Z442 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKD1L2Q7Z442 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKD1L2Q7Z442 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKD1L2Q7Z442 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PKD1L2Q7Z442 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKD1L2Q7Z442 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKD1L2Q7Z442 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PKD1L2Q7Z442 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKD1L2Q7Z442 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKD1L2Q7Z442 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKD1L2Q7Z442 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKD1L2Q7Z442 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKD1L2Q7Z442 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKD1L2Q7Z442 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PKD1L2Q7Z442 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PKD1L2Q7Z442 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PKD1L2Q7Z442 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKD1L2Q7Z442 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKD1L2Q7Z442 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKD1L2Q7Z442 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKD1L2Q7Z442 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD1L2Q7Z442 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD1L2Q7Z442 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD1L2Q7Z442 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD1L2Q7Z442 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD1L2Q7Z442 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD1L2Q7Z442 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PKD1L2Q7Z442 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKD1L2Q7Z442 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKD1L2Q7Z442 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKD1L2Q7Z442 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKD1L2Q7Z442 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKD1L2Q7Z442 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKD1L2Q7Z442 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKD1L2Q7Z442 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKD1L2Q7Z442 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKD1L2Q7Z442 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PKD1L2Q7Z442 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKD1L2Q7Z442 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKD1L2Q7Z442 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKD1L2Q7Z442 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKD1L2Q7Z442 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKD1L2Q7Z442 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKD1L2Q7Z442 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PKD1L2Q7Z442 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD1L2Q7Z442 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKD1L2Q7Z442 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKD1L2Q7Z442 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKD1L2Q7Z442 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKD1L2Q7Z442 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKD1L2Q7Z442 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD1L2Q7Z442 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD1L2Q7Z442 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKD1L2Q7Z442 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKD1L2Q7Z442 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKD1L2Q7Z442 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKD1L2Q7Z442 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKD1L2Q7Z442 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PKD1L2Q7Z442 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKD1L2Q7Z442 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKD1L2Q7Z442 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD1L2Q7Z442 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD1L2Q7Z442 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKD1L2Q7Z442 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PKD1L2Q7Z442 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKD1L2Q7Z442 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKD1L2Q7Z442 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD1L2Q7Z442 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD1L2Q7Z442 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD1L2Q7Z442 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD1L2Q7Z442 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD1L2Q7Z442 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD1L2Q7Z442 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD1L2Q7Z442 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD1L2Q7Z442 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKD1L2Q7Z442 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKD1L2Q7Z442 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKD1L2Q7Z442 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD1L2Q7Z442 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD1L2Q7Z442 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD1L2Q7Z442 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD1L2Q7Z442 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD1L2Q7Z442 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD1L2Q7Z442 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD1L2Q7Z442 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD1L2Q7Z442 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD1L2Q7Z442 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD1L2Q7Z442 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD1L2Q7Z442 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD1L2Q7Z442 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD1L2Q7Z442 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PKD1L2Q7Z442 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms