Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SMIM5Q71RC9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SMIM5Q71RC9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SMIM5Q71RC9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SMIM5Q71RC9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
SMIM5Q71RC9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SMIM5Q71RC9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SMIM5Q71RC9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SMIM5Q71RC9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SMIM5Q71RC9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SMIM5Q71RC9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SMIM5Q71RC9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SMIM5Q71RC9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SMIM5Q71RC9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SMIM5Q71RC9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
SMIM5Q71RC9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SMIM5Q71RC9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SMIM5Q71RC9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SMIM5Q71RC9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SMIM5Q71RC9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SMIM5Q71RC9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SMIM5Q71RC9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SMIM5Q71RC9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SMIM5Q71RC9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SMIM5Q71RC9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SMIM5Q71RC9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SMIM5Q71RC9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SMIM5Q71RC9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SMIM5Q71RC9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
SMIM5Q71RC9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SMIM5Q71RC9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SMIM5Q71RC9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SMIM5Q71RC9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SMIM5Q71RC9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SMIM5Q71RC9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SMIM5Q71RC9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SMIM5Q71RC9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SMIM5Q71RC9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SMIM5Q71RC9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SMIM5Q71RC9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SMIM5Q71RC9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SMIM5Q71RC9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SMIM5Q71RC9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SMIM5Q71RC9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SMIM5Q71RC9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SMIM5Q71RC9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SMIM5Q71RC9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SMIM5Q71RC9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SMIM5Q71RC9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SMIM5Q71RC9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SMIM5Q71RC9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SMIM5Q71RC9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SMIM5Q71RC9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SMIM5Q71RC9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SMIM5Q71RC9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SMIM5Q71RC9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
SMIM5Q71RC9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SMIM5Q71RC9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SMIM5Q71RC9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
SMIM5Q71RC9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SMIM5Q71RC9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SMIM5Q71RC9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.81■■■■□ 3
SMIM5Q71RC9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
SMIM5Q71RC9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SMIM5Q71RC9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
SMIM5Q71RC9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SMIM5Q71RC9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SMIM5Q71RC9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SMIM5Q71RC9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SMIM5Q71RC9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SMIM5Q71RC9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SMIM5Q71RC9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SMIM5Q71RC9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SMIM5Q71RC9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SMIM5Q71RC9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SMIM5Q71RC9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SMIM5Q71RC9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SMIM5Q71RC9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SMIM5Q71RC9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SMIM5Q71RC9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SMIM5Q71RC9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SMIM5Q71RC9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SMIM5Q71RC9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
SMIM5Q71RC9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SMIM5Q71RC9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SMIM5Q71RC9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SMIM5Q71RC9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SMIM5Q71RC9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SMIM5Q71RC9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SMIM5Q71RC9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SMIM5Q71RC9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
SMIM5Q71RC9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SMIM5Q71RC9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
SMIM5Q71RC9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SMIM5Q71RC9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SMIM5Q71RC9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SMIM5Q71RC9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SMIM5Q71RC9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SMIM5Q71RC9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SMIM5Q71RC9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms