Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRC1

C4orf50, Uncharacterized protein C4orf50, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf50Q6ZRC1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C4orf50Q6ZRC1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C4orf50Q6ZRC1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
C4orf50Q6ZRC1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C4orf50Q6ZRC1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C4orf50Q6ZRC1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C4orf50Q6ZRC1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C4orf50Q6ZRC1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C4orf50Q6ZRC1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C4orf50Q6ZRC1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C4orf50Q6ZRC1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C4orf50Q6ZRC1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C4orf50Q6ZRC1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
C4orf50Q6ZRC1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C4orf50Q6ZRC1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C4orf50Q6ZRC1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C4orf50Q6ZRC1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C4orf50Q6ZRC1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C4orf50Q6ZRC1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C4orf50Q6ZRC1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C4orf50Q6ZRC1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C4orf50Q6ZRC1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C4orf50Q6ZRC1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C4orf50Q6ZRC1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C4orf50Q6ZRC1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
C4orf50Q6ZRC1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
C4orf50Q6ZRC1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
C4orf50Q6ZRC1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C4orf50Q6ZRC1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C4orf50Q6ZRC1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C4orf50Q6ZRC1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C4orf50Q6ZRC1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
C4orf50Q6ZRC1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C4orf50Q6ZRC1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C4orf50Q6ZRC1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C4orf50Q6ZRC1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C4orf50Q6ZRC1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
C4orf50Q6ZRC1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C4orf50Q6ZRC1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
C4orf50Q6ZRC1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C4orf50Q6ZRC1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
C4orf50Q6ZRC1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
C4orf50Q6ZRC1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
C4orf50Q6ZRC1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C4orf50Q6ZRC1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
C4orf50Q6ZRC1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C4orf50Q6ZRC1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C4orf50Q6ZRC1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
C4orf50Q6ZRC1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C4orf50Q6ZRC1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C4orf50Q6ZRC1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C4orf50Q6ZRC1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C4orf50Q6ZRC1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C4orf50Q6ZRC1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
C4orf50Q6ZRC1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
C4orf50Q6ZRC1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C4orf50Q6ZRC1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C4orf50Q6ZRC1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C4orf50Q6ZRC1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C4orf50Q6ZRC1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C4orf50Q6ZRC1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
C4orf50Q6ZRC1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
C4orf50Q6ZRC1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C4orf50Q6ZRC1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
C4orf50Q6ZRC1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C4orf50Q6ZRC1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C4orf50Q6ZRC1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
C4orf50Q6ZRC1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C4orf50Q6ZRC1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C4orf50Q6ZRC1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C4orf50Q6ZRC1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C4orf50Q6ZRC1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
C4orf50Q6ZRC1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
C4orf50Q6ZRC1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
C4orf50Q6ZRC1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
C4orf50Q6ZRC1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
C4orf50Q6ZRC1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
C4orf50Q6ZRC1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C4orf50Q6ZRC1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C4orf50Q6ZRC1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C4orf50Q6ZRC1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C4orf50Q6ZRC1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C4orf50Q6ZRC1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C4orf50Q6ZRC1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C4orf50Q6ZRC1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C4orf50Q6ZRC1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
C4orf50Q6ZRC1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
C4orf50Q6ZRC1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
C4orf50Q6ZRC1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C4orf50Q6ZRC1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C4orf50Q6ZRC1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C4orf50Q6ZRC1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C4orf50Q6ZRC1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C4orf50Q6ZRC1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C4orf50Q6ZRC1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
C4orf50Q6ZRC1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C4orf50Q6ZRC1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C4orf50Q6ZRC1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C4orf50Q6ZRC1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C4orf50Q6ZRC1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms