Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN84

CCDC81, Coiled-coil domain-containing protein 81, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC81Q6ZN84 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC81Q6ZN84 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC81Q6ZN84 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC81Q6ZN84 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC81Q6ZN84 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC81Q6ZN84 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC81Q6ZN84 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC81Q6ZN84 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC81Q6ZN84 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC81Q6ZN84 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC81Q6ZN84 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC81Q6ZN84 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC81Q6ZN84 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC81Q6ZN84 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC81Q6ZN84 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC81Q6ZN84 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC81Q6ZN84 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC81Q6ZN84 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC81Q6ZN84 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC81Q6ZN84 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC81Q6ZN84 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC81Q6ZN84 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC81Q6ZN84 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC81Q6ZN84 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC81Q6ZN84 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC81Q6ZN84 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC81Q6ZN84 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC81Q6ZN84 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC81Q6ZN84 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC81Q6ZN84 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC81Q6ZN84 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC81Q6ZN84 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC81Q6ZN84 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC81Q6ZN84 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC81Q6ZN84 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC81Q6ZN84 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC81Q6ZN84 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC81Q6ZN84 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC81Q6ZN84 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC81Q6ZN84 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC81Q6ZN84 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC81Q6ZN84 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC81Q6ZN84 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC81Q6ZN84 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC81Q6ZN84 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC81Q6ZN84 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC81Q6ZN84 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC81Q6ZN84 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC81Q6ZN84 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC81Q6ZN84 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC81Q6ZN84 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC81Q6ZN84 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC81Q6ZN84 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC81Q6ZN84 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC81Q6ZN84 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC81Q6ZN84 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC81Q6ZN84 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC81Q6ZN84 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC81Q6ZN84 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC81Q6ZN84 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC81Q6ZN84 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC81Q6ZN84 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC81Q6ZN84 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC81Q6ZN84 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC81Q6ZN84 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC81Q6ZN84 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC81Q6ZN84 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC81Q6ZN84 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC81Q6ZN84 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC81Q6ZN84 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC81Q6ZN84 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC81Q6ZN84 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC81Q6ZN84 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC81Q6ZN84 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC81Q6ZN84 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC81Q6ZN84 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC81Q6ZN84 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC81Q6ZN84 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC81Q6ZN84 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC81Q6ZN84 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC81Q6ZN84 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC81Q6ZN84 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC81Q6ZN84 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC81Q6ZN84 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC81Q6ZN84 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC81Q6ZN84 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC81Q6ZN84 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC81Q6ZN84 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC81Q6ZN84 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC81Q6ZN84 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC81Q6ZN84 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC81Q6ZN84 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC81Q6ZN84 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC81Q6ZN84 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC81Q6ZN84 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC81Q6ZN84 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC81Q6ZN84 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC81Q6ZN84 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC81Q6ZN84 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC81Q6ZN84 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms