Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN28

MACC1, Metastasis-associated in colon cancer protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MACC1Q6ZN28 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MACC1Q6ZN28 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MACC1Q6ZN28 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MACC1Q6ZN28 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MACC1Q6ZN28 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MACC1Q6ZN28 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MACC1Q6ZN28 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MACC1Q6ZN28 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MACC1Q6ZN28 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MACC1Q6ZN28 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MACC1Q6ZN28 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MACC1Q6ZN28 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MACC1Q6ZN28 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MACC1Q6ZN28 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MACC1Q6ZN28 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MACC1Q6ZN28 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MACC1Q6ZN28 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MACC1Q6ZN28 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
MACC1Q6ZN28 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MACC1Q6ZN28 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MACC1Q6ZN28 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
MACC1Q6ZN28 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MACC1Q6ZN28 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MACC1Q6ZN28 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MACC1Q6ZN28 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MACC1Q6ZN28 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MACC1Q6ZN28 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
MACC1Q6ZN28 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MACC1Q6ZN28 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MACC1Q6ZN28 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MACC1Q6ZN28 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MACC1Q6ZN28 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MACC1Q6ZN28 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MACC1Q6ZN28 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MACC1Q6ZN28 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MACC1Q6ZN28 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MACC1Q6ZN28 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MACC1Q6ZN28 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MACC1Q6ZN28 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MACC1Q6ZN28 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
MACC1Q6ZN28 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MACC1Q6ZN28 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MACC1Q6ZN28 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
MACC1Q6ZN28 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MACC1Q6ZN28 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MACC1Q6ZN28 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MACC1Q6ZN28 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MACC1Q6ZN28 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MACC1Q6ZN28 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MACC1Q6ZN28 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MACC1Q6ZN28 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
MACC1Q6ZN28 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MACC1Q6ZN28 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MACC1Q6ZN28 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
MACC1Q6ZN28 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MACC1Q6ZN28 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MACC1Q6ZN28 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MACC1Q6ZN28 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MACC1Q6ZN28 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MACC1Q6ZN28 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MACC1Q6ZN28 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MACC1Q6ZN28 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MACC1Q6ZN28 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MACC1Q6ZN28 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MACC1Q6ZN28 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MACC1Q6ZN28 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MACC1Q6ZN28 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MACC1Q6ZN28 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MACC1Q6ZN28 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MACC1Q6ZN28 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MACC1Q6ZN28 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MACC1Q6ZN28 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MACC1Q6ZN28 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MACC1Q6ZN28 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MACC1Q6ZN28 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MACC1Q6ZN28 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MACC1Q6ZN28 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MACC1Q6ZN28 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MACC1Q6ZN28 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MACC1Q6ZN28 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MACC1Q6ZN28 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MACC1Q6ZN28 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MACC1Q6ZN28 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MACC1Q6ZN28 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MACC1Q6ZN28 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MACC1Q6ZN28 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MACC1Q6ZN28 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MACC1Q6ZN28 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MACC1Q6ZN28 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MACC1Q6ZN28 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MACC1Q6ZN28 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MACC1Q6ZN28 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MACC1Q6ZN28 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MACC1Q6ZN28 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MACC1Q6ZN28 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MACC1Q6ZN28 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MACC1Q6ZN28 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MACC1Q6ZN28 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MACC1Q6ZN28 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MACC1Q6ZN28 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 214.7 ms