Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC36A4Q6YBV0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC36A4Q6YBV0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC36A4Q6YBV0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC36A4Q6YBV0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC36A4Q6YBV0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC36A4Q6YBV0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC36A4Q6YBV0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC36A4Q6YBV0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC36A4Q6YBV0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC36A4Q6YBV0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC36A4Q6YBV0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC36A4Q6YBV0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC36A4Q6YBV0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC36A4Q6YBV0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC36A4Q6YBV0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC36A4Q6YBV0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC36A4Q6YBV0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC36A4Q6YBV0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC36A4Q6YBV0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC36A4Q6YBV0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC36A4Q6YBV0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC36A4Q6YBV0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC36A4Q6YBV0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC36A4Q6YBV0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC36A4Q6YBV0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC36A4Q6YBV0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC36A4Q6YBV0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC36A4Q6YBV0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC36A4Q6YBV0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC36A4Q6YBV0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC36A4Q6YBV0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC36A4Q6YBV0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC36A4Q6YBV0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC36A4Q6YBV0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC36A4Q6YBV0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC36A4Q6YBV0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC36A4Q6YBV0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC36A4Q6YBV0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC36A4Q6YBV0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC36A4Q6YBV0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC36A4Q6YBV0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC36A4Q6YBV0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC36A4Q6YBV0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC36A4Q6YBV0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC36A4Q6YBV0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC36A4Q6YBV0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC36A4Q6YBV0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC36A4Q6YBV0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC36A4Q6YBV0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC36A4Q6YBV0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SLC36A4Q6YBV0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC36A4Q6YBV0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC36A4Q6YBV0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC36A4Q6YBV0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC36A4Q6YBV0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC36A4Q6YBV0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC36A4Q6YBV0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC36A4Q6YBV0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC36A4Q6YBV0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC36A4Q6YBV0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC36A4Q6YBV0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC36A4Q6YBV0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC36A4Q6YBV0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC36A4Q6YBV0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC36A4Q6YBV0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC36A4Q6YBV0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC36A4Q6YBV0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC36A4Q6YBV0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC36A4Q6YBV0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC36A4Q6YBV0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC36A4Q6YBV0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC36A4Q6YBV0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC36A4Q6YBV0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC36A4Q6YBV0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC36A4Q6YBV0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC36A4Q6YBV0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC36A4Q6YBV0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC36A4Q6YBV0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC36A4Q6YBV0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC36A4Q6YBV0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC36A4Q6YBV0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC36A4Q6YBV0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC36A4Q6YBV0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC36A4Q6YBV0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC36A4Q6YBV0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC36A4Q6YBV0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC36A4Q6YBV0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC36A4Q6YBV0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC36A4Q6YBV0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC36A4Q6YBV0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC36A4Q6YBV0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC36A4Q6YBV0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC36A4Q6YBV0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC36A4Q6YBV0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC36A4Q6YBV0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC36A4Q6YBV0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC36A4Q6YBV0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC36A4Q6YBV0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC36A4Q6YBV0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms