Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABRAXAS1Q6UWZ7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABRAXAS1Q6UWZ7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABRAXAS1Q6UWZ7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABRAXAS1Q6UWZ7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABRAXAS1Q6UWZ7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABRAXAS1Q6UWZ7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABRAXAS1Q6UWZ7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ABRAXAS1Q6UWZ7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ABRAXAS1Q6UWZ7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABRAXAS1Q6UWZ7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABRAXAS1Q6UWZ7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABRAXAS1Q6UWZ7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABRAXAS1Q6UWZ7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABRAXAS1Q6UWZ7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABRAXAS1Q6UWZ7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABRAXAS1Q6UWZ7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABRAXAS1Q6UWZ7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABRAXAS1Q6UWZ7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABRAXAS1Q6UWZ7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABRAXAS1Q6UWZ7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABRAXAS1Q6UWZ7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ABRAXAS1Q6UWZ7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ABRAXAS1Q6UWZ7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABRAXAS1Q6UWZ7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABRAXAS1Q6UWZ7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABRAXAS1Q6UWZ7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABRAXAS1Q6UWZ7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABRAXAS1Q6UWZ7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABRAXAS1Q6UWZ7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABRAXAS1Q6UWZ7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABRAXAS1Q6UWZ7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ABRAXAS1Q6UWZ7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABRAXAS1Q6UWZ7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABRAXAS1Q6UWZ7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABRAXAS1Q6UWZ7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABRAXAS1Q6UWZ7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms