Protein–RNA interactions for Protein: Q6U736

OPN5, Opsin-5, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN5Q6U736 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OPN5Q6U736 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OPN5Q6U736 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OPN5Q6U736 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OPN5Q6U736 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OPN5Q6U736 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OPN5Q6U736 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
OPN5Q6U736 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OPN5Q6U736 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OPN5Q6U736 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OPN5Q6U736 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OPN5Q6U736 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OPN5Q6U736 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OPN5Q6U736 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OPN5Q6U736 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OPN5Q6U736 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OPN5Q6U736 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OPN5Q6U736 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OPN5Q6U736 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OPN5Q6U736 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OPN5Q6U736 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OPN5Q6U736 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OPN5Q6U736 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OPN5Q6U736 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OPN5Q6U736 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
OPN5Q6U736 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OPN5Q6U736 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OPN5Q6U736 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OPN5Q6U736 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OPN5Q6U736 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
OPN5Q6U736 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
OPN5Q6U736 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
OPN5Q6U736 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OPN5Q6U736 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OPN5Q6U736 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OPN5Q6U736 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OPN5Q6U736 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OPN5Q6U736 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
OPN5Q6U736 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OPN5Q6U736 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OPN5Q6U736 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OPN5Q6U736 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OPN5Q6U736 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OPN5Q6U736 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OPN5Q6U736 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OPN5Q6U736 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OPN5Q6U736 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OPN5Q6U736 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OPN5Q6U736 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OPN5Q6U736 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OPN5Q6U736 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
OPN5Q6U736 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OPN5Q6U736 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OPN5Q6U736 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OPN5Q6U736 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OPN5Q6U736 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OPN5Q6U736 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OPN5Q6U736 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OPN5Q6U736 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OPN5Q6U736 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OPN5Q6U736 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OPN5Q6U736 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OPN5Q6U736 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OPN5Q6U736 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OPN5Q6U736 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OPN5Q6U736 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OPN5Q6U736 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OPN5Q6U736 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OPN5Q6U736 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OPN5Q6U736 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OPN5Q6U736 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OPN5Q6U736 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OPN5Q6U736 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OPN5Q6U736 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OPN5Q6U736 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OPN5Q6U736 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OPN5Q6U736 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OPN5Q6U736 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OPN5Q6U736 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
OPN5Q6U736 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OPN5Q6U736 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OPN5Q6U736 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OPN5Q6U736 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OPN5Q6U736 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OPN5Q6U736 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OPN5Q6U736 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OPN5Q6U736 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
OPN5Q6U736 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
OPN5Q6U736 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OPN5Q6U736 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OPN5Q6U736 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OPN5Q6U736 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OPN5Q6U736 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OPN5Q6U736 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OPN5Q6U736 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OPN5Q6U736 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OPN5Q6U736 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
OPN5Q6U736 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OPN5Q6U736 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
OPN5Q6U736 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms