Protein–RNA interactions for Protein: Q6PL24

TMED8, Protein TMED8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED8Q6PL24 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
TMED8Q6PL24 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TMED8Q6PL24 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TMED8Q6PL24 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TMED8Q6PL24 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TMED8Q6PL24 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TMED8Q6PL24 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TMED8Q6PL24 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
TMED8Q6PL24 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TMED8Q6PL24 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
TMED8Q6PL24 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TMED8Q6PL24 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TMED8Q6PL24 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TMED8Q6PL24 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TMED8Q6PL24 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
TMED8Q6PL24 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TMED8Q6PL24 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TMED8Q6PL24 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TMED8Q6PL24 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TMED8Q6PL24 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TMED8Q6PL24 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TMED8Q6PL24 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TMED8Q6PL24 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TMED8Q6PL24 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TMED8Q6PL24 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TMED8Q6PL24 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TMED8Q6PL24 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TMED8Q6PL24 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TMED8Q6PL24 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TMED8Q6PL24 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TMED8Q6PL24 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TMED8Q6PL24 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TMED8Q6PL24 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TMED8Q6PL24 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TMED8Q6PL24 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TMED8Q6PL24 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TMED8Q6PL24 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
TMED8Q6PL24 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TMED8Q6PL24 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TMED8Q6PL24 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TMED8Q6PL24 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TMED8Q6PL24 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TMED8Q6PL24 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TMED8Q6PL24 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TMED8Q6PL24 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
TMED8Q6PL24 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TMED8Q6PL24 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TMED8Q6PL24 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TMED8Q6PL24 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TMED8Q6PL24 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TMED8Q6PL24 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TMED8Q6PL24 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TMED8Q6PL24 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TMED8Q6PL24 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TMED8Q6PL24 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TMED8Q6PL24 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TMED8Q6PL24 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TMED8Q6PL24 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TMED8Q6PL24 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TMED8Q6PL24 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TMED8Q6PL24 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TMED8Q6PL24 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TMED8Q6PL24 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
TMED8Q6PL24 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TMED8Q6PL24 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TMED8Q6PL24 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TMED8Q6PL24 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TMED8Q6PL24 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TMED8Q6PL24 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TMED8Q6PL24 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TMED8Q6PL24 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TMED8Q6PL24 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TMED8Q6PL24 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TMED8Q6PL24 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TMED8Q6PL24 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
TMED8Q6PL24 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TMED8Q6PL24 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TMED8Q6PL24 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TMED8Q6PL24 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
TMED8Q6PL24 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
TMED8Q6PL24 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
TMED8Q6PL24 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TMED8Q6PL24 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TMED8Q6PL24 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TMED8Q6PL24 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TMED8Q6PL24 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TMED8Q6PL24 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TMED8Q6PL24 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TMED8Q6PL24 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TMED8Q6PL24 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TMED8Q6PL24 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TMED8Q6PL24 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TMED8Q6PL24 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TMED8Q6PL24 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TMED8Q6PL24 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TMED8Q6PL24 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TMED8Q6PL24 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TMED8Q6PL24 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
TMED8Q6PL24 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TMED8Q6PL24 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms