Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4A7

SFXN4, Sideroflexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN4Q6P4A7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFXN4Q6P4A7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFXN4Q6P4A7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFXN4Q6P4A7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFXN4Q6P4A7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFXN4Q6P4A7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFXN4Q6P4A7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFXN4Q6P4A7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFXN4Q6P4A7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFXN4Q6P4A7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFXN4Q6P4A7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFXN4Q6P4A7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFXN4Q6P4A7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFXN4Q6P4A7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFXN4Q6P4A7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFXN4Q6P4A7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFXN4Q6P4A7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFXN4Q6P4A7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFXN4Q6P4A7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFXN4Q6P4A7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFXN4Q6P4A7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFXN4Q6P4A7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFXN4Q6P4A7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFXN4Q6P4A7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFXN4Q6P4A7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFXN4Q6P4A7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SFXN4Q6P4A7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFXN4Q6P4A7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFXN4Q6P4A7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFXN4Q6P4A7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFXN4Q6P4A7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFXN4Q6P4A7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFXN4Q6P4A7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFXN4Q6P4A7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFXN4Q6P4A7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFXN4Q6P4A7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SFXN4Q6P4A7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFXN4Q6P4A7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFXN4Q6P4A7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFXN4Q6P4A7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFXN4Q6P4A7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFXN4Q6P4A7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFXN4Q6P4A7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFXN4Q6P4A7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFXN4Q6P4A7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFXN4Q6P4A7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFXN4Q6P4A7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFXN4Q6P4A7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFXN4Q6P4A7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFXN4Q6P4A7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFXN4Q6P4A7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFXN4Q6P4A7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFXN4Q6P4A7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFXN4Q6P4A7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFXN4Q6P4A7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFXN4Q6P4A7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFXN4Q6P4A7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFXN4Q6P4A7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFXN4Q6P4A7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFXN4Q6P4A7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SFXN4Q6P4A7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFXN4Q6P4A7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFXN4Q6P4A7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFXN4Q6P4A7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFXN4Q6P4A7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFXN4Q6P4A7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFXN4Q6P4A7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFXN4Q6P4A7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFXN4Q6P4A7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFXN4Q6P4A7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFXN4Q6P4A7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFXN4Q6P4A7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SFXN4Q6P4A7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFXN4Q6P4A7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFXN4Q6P4A7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFXN4Q6P4A7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFXN4Q6P4A7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFXN4Q6P4A7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SFXN4Q6P4A7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFXN4Q6P4A7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFXN4Q6P4A7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFXN4Q6P4A7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFXN4Q6P4A7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFXN4Q6P4A7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFXN4Q6P4A7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFXN4Q6P4A7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFXN4Q6P4A7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFXN4Q6P4A7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFXN4Q6P4A7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFXN4Q6P4A7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFXN4Q6P4A7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFXN4Q6P4A7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SFXN4Q6P4A7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SFXN4Q6P4A7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFXN4Q6P4A7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFXN4Q6P4A7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFXN4Q6P4A7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFXN4Q6P4A7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFXN4Q6P4A7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFXN4Q6P4A7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms