Protein–RNA interactions for Protein: Q6P087

RPUSD3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase RPUSD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3Q6P087 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPUSD3Q6P087 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RPUSD3Q6P087 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPUSD3Q6P087 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPUSD3Q6P087 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPUSD3Q6P087 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPUSD3Q6P087 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPUSD3Q6P087 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPUSD3Q6P087 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPUSD3Q6P087 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPUSD3Q6P087 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPUSD3Q6P087 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPUSD3Q6P087 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPUSD3Q6P087 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPUSD3Q6P087 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPUSD3Q6P087 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPUSD3Q6P087 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPUSD3Q6P087 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPUSD3Q6P087 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPUSD3Q6P087 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPUSD3Q6P087 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPUSD3Q6P087 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPUSD3Q6P087 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPUSD3Q6P087 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPUSD3Q6P087 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPUSD3Q6P087 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPUSD3Q6P087 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPUSD3Q6P087 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPUSD3Q6P087 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPUSD3Q6P087 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RPUSD3Q6P087 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPUSD3Q6P087 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RPUSD3Q6P087 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RPUSD3Q6P087 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RPUSD3Q6P087 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RPUSD3Q6P087 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RPUSD3Q6P087 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RPUSD3Q6P087 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RPUSD3Q6P087 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RPUSD3Q6P087 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPUSD3Q6P087 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPUSD3Q6P087 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPUSD3Q6P087 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPUSD3Q6P087 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPUSD3Q6P087 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPUSD3Q6P087 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPUSD3Q6P087 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPUSD3Q6P087 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPUSD3Q6P087 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPUSD3Q6P087 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPUSD3Q6P087 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPUSD3Q6P087 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPUSD3Q6P087 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RPUSD3Q6P087 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPUSD3Q6P087 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPUSD3Q6P087 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPUSD3Q6P087 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPUSD3Q6P087 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPUSD3Q6P087 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPUSD3Q6P087 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPUSD3Q6P087 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RPUSD3Q6P087 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPUSD3Q6P087 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPUSD3Q6P087 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPUSD3Q6P087 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPUSD3Q6P087 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPUSD3Q6P087 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPUSD3Q6P087 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPUSD3Q6P087 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPUSD3Q6P087 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPUSD3Q6P087 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPUSD3Q6P087 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPUSD3Q6P087 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPUSD3Q6P087 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPUSD3Q6P087 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPUSD3Q6P087 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPUSD3Q6P087 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPUSD3Q6P087 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPUSD3Q6P087 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPUSD3Q6P087 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPUSD3Q6P087 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPUSD3Q6P087 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RPUSD3Q6P087 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPUSD3Q6P087 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPUSD3Q6P087 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPUSD3Q6P087 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPUSD3Q6P087 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPUSD3Q6P087 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPUSD3Q6P087 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPUSD3Q6P087 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPUSD3Q6P087 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPUSD3Q6P087 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPUSD3Q6P087 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPUSD3Q6P087 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPUSD3Q6P087 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPUSD3Q6P087 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPUSD3Q6P087 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPUSD3Q6P087 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPUSD3Q6P087 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPUSD3Q6P087 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms