Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RCSD1Q6JBY9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RCSD1Q6JBY9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RCSD1Q6JBY9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RCSD1Q6JBY9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RCSD1Q6JBY9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RCSD1Q6JBY9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RCSD1Q6JBY9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RCSD1Q6JBY9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RCSD1Q6JBY9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RCSD1Q6JBY9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
RCSD1Q6JBY9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RCSD1Q6JBY9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RCSD1Q6JBY9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RCSD1Q6JBY9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RCSD1Q6JBY9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
RCSD1Q6JBY9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
RCSD1Q6JBY9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
RCSD1Q6JBY9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
RCSD1Q6JBY9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RCSD1Q6JBY9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RCSD1Q6JBY9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
RCSD1Q6JBY9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RCSD1Q6JBY9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RCSD1Q6JBY9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RCSD1Q6JBY9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RCSD1Q6JBY9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RCSD1Q6JBY9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RCSD1Q6JBY9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RCSD1Q6JBY9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RCSD1Q6JBY9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
RCSD1Q6JBY9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RCSD1Q6JBY9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
RCSD1Q6JBY9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RCSD1Q6JBY9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RCSD1Q6JBY9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RCSD1Q6JBY9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RCSD1Q6JBY9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RCSD1Q6JBY9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RCSD1Q6JBY9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
RCSD1Q6JBY9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RCSD1Q6JBY9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
RCSD1Q6JBY9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RCSD1Q6JBY9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RCSD1Q6JBY9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RCSD1Q6JBY9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RCSD1Q6JBY9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RCSD1Q6JBY9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RCSD1Q6JBY9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RCSD1Q6JBY9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RCSD1Q6JBY9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RCSD1Q6JBY9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RCSD1Q6JBY9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RCSD1Q6JBY9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RCSD1Q6JBY9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RCSD1Q6JBY9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RCSD1Q6JBY9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RCSD1Q6JBY9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RCSD1Q6JBY9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RCSD1Q6JBY9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RCSD1Q6JBY9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RCSD1Q6JBY9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
RCSD1Q6JBY9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RCSD1Q6JBY9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RCSD1Q6JBY9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RCSD1Q6JBY9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RCSD1Q6JBY9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RCSD1Q6JBY9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RCSD1Q6JBY9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RCSD1Q6JBY9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RCSD1Q6JBY9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
RCSD1Q6JBY9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
RCSD1Q6JBY9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RCSD1Q6JBY9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RCSD1Q6JBY9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RCSD1Q6JBY9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RCSD1Q6JBY9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RCSD1Q6JBY9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RCSD1Q6JBY9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RCSD1Q6JBY9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
RCSD1Q6JBY9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RCSD1Q6JBY9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RCSD1Q6JBY9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RCSD1Q6JBY9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RCSD1Q6JBY9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
RCSD1Q6JBY9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
RCSD1Q6JBY9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RCSD1Q6JBY9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RCSD1Q6JBY9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RCSD1Q6JBY9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RCSD1Q6JBY9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RCSD1Q6JBY9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RCSD1Q6JBY9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RCSD1Q6JBY9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RCSD1Q6JBY9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RCSD1Q6JBY9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RCSD1Q6JBY9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RCSD1Q6JBY9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RCSD1Q6JBY9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RCSD1Q6JBY9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms