Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV28

TMEM225, Transmembrane protein 225, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225Q6GV28 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM225Q6GV28 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM225Q6GV28 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM225Q6GV28 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM225Q6GV28 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM225Q6GV28 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM225Q6GV28 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM225Q6GV28 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM225Q6GV28 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM225Q6GV28 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM225Q6GV28 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM225Q6GV28 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM225Q6GV28 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM225Q6GV28 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM225Q6GV28 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM225Q6GV28 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM225Q6GV28 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM225Q6GV28 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM225Q6GV28 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM225Q6GV28 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM225Q6GV28 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM225Q6GV28 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM225Q6GV28 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM225Q6GV28 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM225Q6GV28 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM225Q6GV28 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM225Q6GV28 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM225Q6GV28 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM225Q6GV28 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM225Q6GV28 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM225Q6GV28 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM225Q6GV28 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM225Q6GV28 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM225Q6GV28 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM225Q6GV28 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM225Q6GV28 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM225Q6GV28 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM225Q6GV28 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM225Q6GV28 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM225Q6GV28 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM225Q6GV28 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM225Q6GV28 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM225Q6GV28 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM225Q6GV28 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM225Q6GV28 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM225Q6GV28 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM225Q6GV28 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM225Q6GV28 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM225Q6GV28 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM225Q6GV28 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM225Q6GV28 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM225Q6GV28 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM225Q6GV28 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM225Q6GV28 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM225Q6GV28 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM225Q6GV28 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM225Q6GV28 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM225Q6GV28 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM225Q6GV28 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM225Q6GV28 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM225Q6GV28 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM225Q6GV28 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM225Q6GV28 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM225Q6GV28 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM225Q6GV28 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM225Q6GV28 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM225Q6GV28 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM225Q6GV28 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM225Q6GV28 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM225Q6GV28 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM225Q6GV28 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM225Q6GV28 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM225Q6GV28 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM225Q6GV28 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM225Q6GV28 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM225Q6GV28 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM225Q6GV28 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM225Q6GV28 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM225Q6GV28 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM225Q6GV28 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM225Q6GV28 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM225Q6GV28 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM225Q6GV28 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM225Q6GV28 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM225Q6GV28 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM225Q6GV28 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM225Q6GV28 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM225Q6GV28 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM225Q6GV28 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM225Q6GV28 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM225Q6GV28 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM225Q6GV28 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM225Q6GV28 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM225Q6GV28 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM225Q6GV28 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM225Q6GV28 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM225Q6GV28 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM225Q6GV28 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM225Q6GV28 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM225Q6GV28 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms