Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
RNF123Q5XPI4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
RNF123Q5XPI4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
RNF123Q5XPI4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
RNF123Q5XPI4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
RNF123Q5XPI4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
RNF123Q5XPI4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
RNF123Q5XPI4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
RNF123Q5XPI4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
RNF123Q5XPI4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
RNF123Q5XPI4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
RNF123Q5XPI4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
RNF123Q5XPI4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
RNF123Q5XPI4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
RNF123Q5XPI4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
RNF123Q5XPI4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
RNF123Q5XPI4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
RNF123Q5XPI4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
RNF123Q5XPI4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
RNF123Q5XPI4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
RNF123Q5XPI4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
RNF123Q5XPI4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
RNF123Q5XPI4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
RNF123Q5XPI4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
RNF123Q5XPI4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
RNF123Q5XPI4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
RNF123Q5XPI4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
RNF123Q5XPI4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RNF123Q5XPI4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
RNF123Q5XPI4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
RNF123Q5XPI4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
RNF123Q5XPI4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
RNF123Q5XPI4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
RNF123Q5XPI4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
RNF123Q5XPI4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
RNF123Q5XPI4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
RNF123Q5XPI4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
RNF123Q5XPI4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
RNF123Q5XPI4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
RNF123Q5XPI4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
RNF123Q5XPI4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
RNF123Q5XPI4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
RNF123Q5XPI4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
RNF123Q5XPI4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
RNF123Q5XPI4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RNF123Q5XPI4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
RNF123Q5XPI4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
RNF123Q5XPI4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
RNF123Q5XPI4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
RNF123Q5XPI4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RNF123Q5XPI4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
RNF123Q5XPI4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RNF123Q5XPI4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
RNF123Q5XPI4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
RNF123Q5XPI4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
RNF123Q5XPI4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RNF123Q5XPI4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
RNF123Q5XPI4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
RNF123Q5XPI4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
RNF123Q5XPI4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
RNF123Q5XPI4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
RNF123Q5XPI4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
RNF123Q5XPI4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
RNF123Q5XPI4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
RNF123Q5XPI4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
RNF123Q5XPI4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
RNF123Q5XPI4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
RNF123Q5XPI4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
RNF123Q5XPI4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
RNF123Q5XPI4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RNF123Q5XPI4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RNF123Q5XPI4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
RNF123Q5XPI4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
RNF123Q5XPI4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
RNF123Q5XPI4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
RNF123Q5XPI4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
RNF123Q5XPI4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
RNF123Q5XPI4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
RNF123Q5XPI4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
RNF123Q5XPI4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
RNF123Q5XPI4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
RNF123Q5XPI4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
RNF123Q5XPI4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RNF123Q5XPI4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
RNF123Q5XPI4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
RNF123Q5XPI4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
RNF123Q5XPI4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
RNF123Q5XPI4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
RNF123Q5XPI4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
RNF123Q5XPI4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RNF123Q5XPI4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RNF123Q5XPI4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
RNF123Q5XPI4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
RNF123Q5XPI4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
RNF123Q5XPI4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
RNF123Q5XPI4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
RNF123Q5XPI4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
RNF123Q5XPI4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RNF123Q5XPI4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RNF123Q5XPI4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.5 ms