Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BROXQ5VW32 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BROXQ5VW32 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BROXQ5VW32 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BROXQ5VW32 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BROXQ5VW32 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BROXQ5VW32 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BROXQ5VW32 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BROXQ5VW32 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BROXQ5VW32 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BROXQ5VW32 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BROXQ5VW32 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BROXQ5VW32 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BROXQ5VW32 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BROXQ5VW32 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BROXQ5VW32 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BROXQ5VW32 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BROXQ5VW32 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BROXQ5VW32 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BROXQ5VW32 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BROXQ5VW32 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BROXQ5VW32 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BROXQ5VW32 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BROXQ5VW32 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BROXQ5VW32 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
BROXQ5VW32 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BROXQ5VW32 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BROXQ5VW32 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BROXQ5VW32 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BROXQ5VW32 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BROXQ5VW32 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BROXQ5VW32 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BROXQ5VW32 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BROXQ5VW32 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BROXQ5VW32 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BROXQ5VW32 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BROXQ5VW32 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BROXQ5VW32 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BROXQ5VW32 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BROXQ5VW32 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BROXQ5VW32 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BROXQ5VW32 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BROXQ5VW32 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BROXQ5VW32 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BROXQ5VW32 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BROXQ5VW32 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BROXQ5VW32 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BROXQ5VW32 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BROXQ5VW32 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
BROXQ5VW32 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BROXQ5VW32 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BROXQ5VW32 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BROXQ5VW32 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BROXQ5VW32 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BROXQ5VW32 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BROXQ5VW32 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BROXQ5VW32 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BROXQ5VW32 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BROXQ5VW32 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BROXQ5VW32 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BROXQ5VW32 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BROXQ5VW32 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BROXQ5VW32 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BROXQ5VW32 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BROXQ5VW32 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BROXQ5VW32 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BROXQ5VW32 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BROXQ5VW32 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BROXQ5VW32 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BROXQ5VW32 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BROXQ5VW32 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BROXQ5VW32 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BROXQ5VW32 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BROXQ5VW32 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BROXQ5VW32 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BROXQ5VW32 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BROXQ5VW32 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BROXQ5VW32 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BROXQ5VW32 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BROXQ5VW32 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BROXQ5VW32 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BROXQ5VW32 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BROXQ5VW32 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BROXQ5VW32 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BROXQ5VW32 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BROXQ5VW32 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BROXQ5VW32 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BROXQ5VW32 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BROXQ5VW32 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BROXQ5VW32 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BROXQ5VW32 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BROXQ5VW32 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BROXQ5VW32 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BROXQ5VW32 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BROXQ5VW32 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BROXQ5VW32 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BROXQ5VW32 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BROXQ5VW32 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BROXQ5VW32 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BROXQ5VW32 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms