Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GKAP1Q5VSY0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GKAP1Q5VSY0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GKAP1Q5VSY0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GKAP1Q5VSY0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GKAP1Q5VSY0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GKAP1Q5VSY0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GKAP1Q5VSY0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GKAP1Q5VSY0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GKAP1Q5VSY0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GKAP1Q5VSY0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GKAP1Q5VSY0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GKAP1Q5VSY0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GKAP1Q5VSY0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GKAP1Q5VSY0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GKAP1Q5VSY0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GKAP1Q5VSY0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GKAP1Q5VSY0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GKAP1Q5VSY0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GKAP1Q5VSY0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GKAP1Q5VSY0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GKAP1Q5VSY0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GKAP1Q5VSY0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GKAP1Q5VSY0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GKAP1Q5VSY0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GKAP1Q5VSY0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GKAP1Q5VSY0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GKAP1Q5VSY0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GKAP1Q5VSY0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GKAP1Q5VSY0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GKAP1Q5VSY0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GKAP1Q5VSY0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GKAP1Q5VSY0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GKAP1Q5VSY0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GKAP1Q5VSY0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GKAP1Q5VSY0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GKAP1Q5VSY0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GKAP1Q5VSY0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GKAP1Q5VSY0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GKAP1Q5VSY0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GKAP1Q5VSY0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GKAP1Q5VSY0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GKAP1Q5VSY0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GKAP1Q5VSY0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GKAP1Q5VSY0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GKAP1Q5VSY0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GKAP1Q5VSY0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GKAP1Q5VSY0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GKAP1Q5VSY0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GKAP1Q5VSY0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GKAP1Q5VSY0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GKAP1Q5VSY0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GKAP1Q5VSY0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
GKAP1Q5VSY0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
GKAP1Q5VSY0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
GKAP1Q5VSY0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GKAP1Q5VSY0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GKAP1Q5VSY0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GKAP1Q5VSY0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GKAP1Q5VSY0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GKAP1Q5VSY0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GKAP1Q5VSY0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GKAP1Q5VSY0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GKAP1Q5VSY0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GKAP1Q5VSY0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GKAP1Q5VSY0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GKAP1Q5VSY0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GKAP1Q5VSY0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GKAP1Q5VSY0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GKAP1Q5VSY0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GKAP1Q5VSY0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GKAP1Q5VSY0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GKAP1Q5VSY0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GKAP1Q5VSY0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GKAP1Q5VSY0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GKAP1Q5VSY0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GKAP1Q5VSY0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GKAP1Q5VSY0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GKAP1Q5VSY0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GKAP1Q5VSY0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GKAP1Q5VSY0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GKAP1Q5VSY0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GKAP1Q5VSY0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GKAP1Q5VSY0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GKAP1Q5VSY0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GKAP1Q5VSY0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GKAP1Q5VSY0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GKAP1Q5VSY0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GKAP1Q5VSY0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GKAP1Q5VSY0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GKAP1Q5VSY0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GKAP1Q5VSY0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GKAP1Q5VSY0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GKAP1Q5VSY0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GKAP1Q5VSY0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GKAP1Q5VSY0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GKAP1Q5VSY0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GKAP1Q5VSY0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GKAP1Q5VSY0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GKAP1Q5VSY0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms