Protein–RNA interactions for Protein: Q5TG30

ARHGAP40, Rho GTPase-activating protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP40Q5TG30 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP40Q5TG30 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP40Q5TG30 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP40Q5TG30 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP40Q5TG30 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP40Q5TG30 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP40Q5TG30 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP40Q5TG30 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGAP40Q5TG30 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGAP40Q5TG30 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGAP40Q5TG30 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGAP40Q5TG30 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGAP40Q5TG30 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGAP40Q5TG30 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGAP40Q5TG30 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGAP40Q5TG30 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGAP40Q5TG30 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGAP40Q5TG30 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGAP40Q5TG30 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGAP40Q5TG30 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGAP40Q5TG30 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGAP40Q5TG30 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGAP40Q5TG30 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGAP40Q5TG30 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGAP40Q5TG30 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGAP40Q5TG30 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGAP40Q5TG30 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGAP40Q5TG30 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGAP40Q5TG30 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGAP40Q5TG30 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGAP40Q5TG30 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGAP40Q5TG30 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGAP40Q5TG30 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGAP40Q5TG30 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGAP40Q5TG30 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGAP40Q5TG30 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGAP40Q5TG30 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGAP40Q5TG30 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGAP40Q5TG30 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGAP40Q5TG30 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGAP40Q5TG30 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARHGAP40Q5TG30 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARHGAP40Q5TG30 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARHGAP40Q5TG30 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGAP40Q5TG30 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGAP40Q5TG30 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGAP40Q5TG30 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGAP40Q5TG30 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGAP40Q5TG30 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGAP40Q5TG30 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGAP40Q5TG30 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGAP40Q5TG30 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGAP40Q5TG30 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGAP40Q5TG30 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGAP40Q5TG30 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGAP40Q5TG30 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGAP40Q5TG30 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGAP40Q5TG30 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGAP40Q5TG30 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGAP40Q5TG30 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP40Q5TG30 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP40Q5TG30 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP40Q5TG30 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP40Q5TG30 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP40Q5TG30 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP40Q5TG30 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP40Q5TG30 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP40Q5TG30 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP40Q5TG30 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP40Q5TG30 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP40Q5TG30 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP40Q5TG30 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP40Q5TG30 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGAP40Q5TG30 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGAP40Q5TG30 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGAP40Q5TG30 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGAP40Q5TG30 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGAP40Q5TG30 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARHGAP40Q5TG30 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGAP40Q5TG30 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGAP40Q5TG30 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGAP40Q5TG30 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGAP40Q5TG30 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGAP40Q5TG30 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGAP40Q5TG30 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGAP40Q5TG30 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGAP40Q5TG30 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGAP40Q5TG30 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGAP40Q5TG30 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGAP40Q5TG30 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGAP40Q5TG30 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGAP40Q5TG30 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGAP40Q5TG30 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGAP40Q5TG30 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGAP40Q5TG30 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGAP40Q5TG30 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGAP40Q5TG30 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGAP40Q5TG30 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGAP40Q5TG30 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGAP40Q5TG30 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms