Protein–RNA interactions for Protein: Q5T447

HECTD3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD3Q5T447 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HECTD3Q5T447 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HECTD3Q5T447 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
HECTD3Q5T447 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HECTD3Q5T447 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HECTD3Q5T447 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HECTD3Q5T447 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HECTD3Q5T447 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
HECTD3Q5T447 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HECTD3Q5T447 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
HECTD3Q5T447 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HECTD3Q5T447 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
HECTD3Q5T447 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HECTD3Q5T447 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HECTD3Q5T447 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HECTD3Q5T447 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HECTD3Q5T447 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HECTD3Q5T447 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HECTD3Q5T447 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HECTD3Q5T447 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HECTD3Q5T447 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HECTD3Q5T447 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HECTD3Q5T447 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
HECTD3Q5T447 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HECTD3Q5T447 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HECTD3Q5T447 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HECTD3Q5T447 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HECTD3Q5T447 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HECTD3Q5T447 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HECTD3Q5T447 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HECTD3Q5T447 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HECTD3Q5T447 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HECTD3Q5T447 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HECTD3Q5T447 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HECTD3Q5T447 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HECTD3Q5T447 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HECTD3Q5T447 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HECTD3Q5T447 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HECTD3Q5T447 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HECTD3Q5T447 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HECTD3Q5T447 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HECTD3Q5T447 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HECTD3Q5T447 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HECTD3Q5T447 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HECTD3Q5T447 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HECTD3Q5T447 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HECTD3Q5T447 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
HECTD3Q5T447 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
HECTD3Q5T447 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HECTD3Q5T447 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HECTD3Q5T447 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HECTD3Q5T447 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HECTD3Q5T447 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HECTD3Q5T447 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HECTD3Q5T447 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
HECTD3Q5T447 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HECTD3Q5T447 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HECTD3Q5T447 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HECTD3Q5T447 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HECTD3Q5T447 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HECTD3Q5T447 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
HECTD3Q5T447 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
HECTD3Q5T447 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
HECTD3Q5T447 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HECTD3Q5T447 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HECTD3Q5T447 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HECTD3Q5T447 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HECTD3Q5T447 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HECTD3Q5T447 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HECTD3Q5T447 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HECTD3Q5T447 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HECTD3Q5T447 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HECTD3Q5T447 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HECTD3Q5T447 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HECTD3Q5T447 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HECTD3Q5T447 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HECTD3Q5T447 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HECTD3Q5T447 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HECTD3Q5T447 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HECTD3Q5T447 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HECTD3Q5T447 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HECTD3Q5T447 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HECTD3Q5T447 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HECTD3Q5T447 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
HECTD3Q5T447 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HECTD3Q5T447 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
HECTD3Q5T447 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HECTD3Q5T447 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HECTD3Q5T447 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HECTD3Q5T447 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HECTD3Q5T447 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HECTD3Q5T447 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HECTD3Q5T447 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HECTD3Q5T447 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HECTD3Q5T447 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HECTD3Q5T447 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HECTD3Q5T447 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HECTD3Q5T447 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HECTD3Q5T447 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HECTD3Q5T447 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms