Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FRMPD3Q5JV73 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FRMPD3Q5JV73 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FRMPD3Q5JV73 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FRMPD3Q5JV73 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
FRMPD3Q5JV73 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FRMPD3Q5JV73 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FRMPD3Q5JV73 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FRMPD3Q5JV73 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FRMPD3Q5JV73 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
FRMPD3Q5JV73 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
FRMPD3Q5JV73 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
FRMPD3Q5JV73 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FRMPD3Q5JV73 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FRMPD3Q5JV73 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FRMPD3Q5JV73 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FRMPD3Q5JV73 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FRMPD3Q5JV73 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FRMPD3Q5JV73 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FRMPD3Q5JV73 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FRMPD3Q5JV73 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FRMPD3Q5JV73 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FRMPD3Q5JV73 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
FRMPD3Q5JV73 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FRMPD3Q5JV73 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FRMPD3Q5JV73 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FRMPD3Q5JV73 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FRMPD3Q5JV73 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FRMPD3Q5JV73 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FRMPD3Q5JV73 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FRMPD3Q5JV73 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
FRMPD3Q5JV73 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FRMPD3Q5JV73 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FRMPD3Q5JV73 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FRMPD3Q5JV73 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FRMPD3Q5JV73 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FRMPD3Q5JV73 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FRMPD3Q5JV73 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FRMPD3Q5JV73 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FRMPD3Q5JV73 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FRMPD3Q5JV73 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FRMPD3Q5JV73 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FRMPD3Q5JV73 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FRMPD3Q5JV73 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FRMPD3Q5JV73 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FRMPD3Q5JV73 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FRMPD3Q5JV73 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FRMPD3Q5JV73 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FRMPD3Q5JV73 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FRMPD3Q5JV73 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
FRMPD3Q5JV73 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FRMPD3Q5JV73 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FRMPD3Q5JV73 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FRMPD3Q5JV73 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FRMPD3Q5JV73 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FRMPD3Q5JV73 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FRMPD3Q5JV73 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FRMPD3Q5JV73 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FRMPD3Q5JV73 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FRMPD3Q5JV73 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FRMPD3Q5JV73 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FRMPD3Q5JV73 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FRMPD3Q5JV73 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FRMPD3Q5JV73 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
FRMPD3Q5JV73 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
FRMPD3Q5JV73 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FRMPD3Q5JV73 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
FRMPD3Q5JV73 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
FRMPD3Q5JV73 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FRMPD3Q5JV73 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
FRMPD3Q5JV73 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FRMPD3Q5JV73 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FRMPD3Q5JV73 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
FRMPD3Q5JV73 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FRMPD3Q5JV73 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FRMPD3Q5JV73 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FRMPD3Q5JV73 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FRMPD3Q5JV73 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FRMPD3Q5JV73 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FRMPD3Q5JV73 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FRMPD3Q5JV73 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FRMPD3Q5JV73 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FRMPD3Q5JV73 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FRMPD3Q5JV73 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FRMPD3Q5JV73 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FRMPD3Q5JV73 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FRMPD3Q5JV73 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FRMPD3Q5JV73 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FRMPD3Q5JV73 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FRMPD3Q5JV73 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FRMPD3Q5JV73 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
FRMPD3Q5JV73 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FRMPD3Q5JV73 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FRMPD3Q5JV73 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FRMPD3Q5JV73 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FRMPD3Q5JV73 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FRMPD3Q5JV73 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
FRMPD3Q5JV73 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FRMPD3Q5JV73 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
FRMPD3Q5JV73 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms