Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRA6

MIA3, Transport and Golgi organization protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIA3Q5JRA6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MIA3Q5JRA6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MIA3Q5JRA6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MIA3Q5JRA6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MIA3Q5JRA6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MIA3Q5JRA6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MIA3Q5JRA6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MIA3Q5JRA6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MIA3Q5JRA6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MIA3Q5JRA6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MIA3Q5JRA6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MIA3Q5JRA6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MIA3Q5JRA6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MIA3Q5JRA6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MIA3Q5JRA6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MIA3Q5JRA6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MIA3Q5JRA6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MIA3Q5JRA6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MIA3Q5JRA6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MIA3Q5JRA6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MIA3Q5JRA6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MIA3Q5JRA6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MIA3Q5JRA6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MIA3Q5JRA6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MIA3Q5JRA6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MIA3Q5JRA6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MIA3Q5JRA6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MIA3Q5JRA6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MIA3Q5JRA6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MIA3Q5JRA6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
MIA3Q5JRA6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
MIA3Q5JRA6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
MIA3Q5JRA6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MIA3Q5JRA6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MIA3Q5JRA6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MIA3Q5JRA6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
MIA3Q5JRA6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MIA3Q5JRA6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MIA3Q5JRA6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MIA3Q5JRA6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MIA3Q5JRA6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MIA3Q5JRA6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MIA3Q5JRA6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MIA3Q5JRA6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MIA3Q5JRA6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MIA3Q5JRA6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MIA3Q5JRA6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MIA3Q5JRA6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MIA3Q5JRA6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MIA3Q5JRA6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MIA3Q5JRA6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MIA3Q5JRA6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MIA3Q5JRA6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MIA3Q5JRA6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MIA3Q5JRA6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
MIA3Q5JRA6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MIA3Q5JRA6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MIA3Q5JRA6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MIA3Q5JRA6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MIA3Q5JRA6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MIA3Q5JRA6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MIA3Q5JRA6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MIA3Q5JRA6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MIA3Q5JRA6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MIA3Q5JRA6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MIA3Q5JRA6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MIA3Q5JRA6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MIA3Q5JRA6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MIA3Q5JRA6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MIA3Q5JRA6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MIA3Q5JRA6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MIA3Q5JRA6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MIA3Q5JRA6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MIA3Q5JRA6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MIA3Q5JRA6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MIA3Q5JRA6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MIA3Q5JRA6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MIA3Q5JRA6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MIA3Q5JRA6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MIA3Q5JRA6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MIA3Q5JRA6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MIA3Q5JRA6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MIA3Q5JRA6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MIA3Q5JRA6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MIA3Q5JRA6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MIA3Q5JRA6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MIA3Q5JRA6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MIA3Q5JRA6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MIA3Q5JRA6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MIA3Q5JRA6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MIA3Q5JRA6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MIA3Q5JRA6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MIA3Q5JRA6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MIA3Q5JRA6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
MIA3Q5JRA6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MIA3Q5JRA6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MIA3Q5JRA6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MIA3Q5JRA6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MIA3Q5JRA6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MIA3Q5JRA6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms