Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CMPK2Q5EBM0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CMPK2Q5EBM0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CMPK2Q5EBM0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CMPK2Q5EBM0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CMPK2Q5EBM0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CMPK2Q5EBM0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CMPK2Q5EBM0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CMPK2Q5EBM0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CMPK2Q5EBM0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CMPK2Q5EBM0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CMPK2Q5EBM0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CMPK2Q5EBM0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CMPK2Q5EBM0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CMPK2Q5EBM0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CMPK2Q5EBM0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CMPK2Q5EBM0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CMPK2Q5EBM0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CMPK2Q5EBM0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CMPK2Q5EBM0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CMPK2Q5EBM0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CMPK2Q5EBM0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CMPK2Q5EBM0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CMPK2Q5EBM0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CMPK2Q5EBM0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CMPK2Q5EBM0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CMPK2Q5EBM0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CMPK2Q5EBM0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CMPK2Q5EBM0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CMPK2Q5EBM0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CMPK2Q5EBM0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CMPK2Q5EBM0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CMPK2Q5EBM0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CMPK2Q5EBM0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CMPK2Q5EBM0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CMPK2Q5EBM0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CMPK2Q5EBM0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CMPK2Q5EBM0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CMPK2Q5EBM0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CMPK2Q5EBM0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CMPK2Q5EBM0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CMPK2Q5EBM0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CMPK2Q5EBM0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CMPK2Q5EBM0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CMPK2Q5EBM0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CMPK2Q5EBM0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CMPK2Q5EBM0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CMPK2Q5EBM0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CMPK2Q5EBM0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CMPK2Q5EBM0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CMPK2Q5EBM0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CMPK2Q5EBM0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CMPK2Q5EBM0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CMPK2Q5EBM0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CMPK2Q5EBM0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CMPK2Q5EBM0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CMPK2Q5EBM0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CMPK2Q5EBM0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CMPK2Q5EBM0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CMPK2Q5EBM0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CMPK2Q5EBM0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CMPK2Q5EBM0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CMPK2Q5EBM0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CMPK2Q5EBM0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CMPK2Q5EBM0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CMPK2Q5EBM0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CMPK2Q5EBM0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CMPK2Q5EBM0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CMPK2Q5EBM0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CMPK2Q5EBM0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CMPK2Q5EBM0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CMPK2Q5EBM0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CMPK2Q5EBM0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CMPK2Q5EBM0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CMPK2Q5EBM0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CMPK2Q5EBM0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CMPK2Q5EBM0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CMPK2Q5EBM0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CMPK2Q5EBM0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CMPK2Q5EBM0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CMPK2Q5EBM0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CMPK2Q5EBM0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CMPK2Q5EBM0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CMPK2Q5EBM0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CMPK2Q5EBM0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CMPK2Q5EBM0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CMPK2Q5EBM0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CMPK2Q5EBM0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CMPK2Q5EBM0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CMPK2Q5EBM0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CMPK2Q5EBM0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CMPK2Q5EBM0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CMPK2Q5EBM0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CMPK2Q5EBM0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CMPK2Q5EBM0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CMPK2Q5EBM0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CMPK2Q5EBM0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CMPK2Q5EBM0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CMPK2Q5EBM0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CMPK2Q5EBM0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms