Protein–RNA interactions for Protein: Q5BLP8

C4orf48, Neuropeptide-like protein C4orf48, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48Q5BLP8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf48Q5BLP8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf48Q5BLP8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf48Q5BLP8 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf48Q5BLP8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf48Q5BLP8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf48Q5BLP8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf48Q5BLP8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf48Q5BLP8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf48Q5BLP8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf48Q5BLP8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf48Q5BLP8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4orf48Q5BLP8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf48Q5BLP8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf48Q5BLP8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf48Q5BLP8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf48Q5BLP8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf48Q5BLP8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf48Q5BLP8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf48Q5BLP8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf48Q5BLP8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf48Q5BLP8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf48Q5BLP8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf48Q5BLP8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf48Q5BLP8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf48Q5BLP8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf48Q5BLP8 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf48Q5BLP8 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf48Q5BLP8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf48Q5BLP8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf48Q5BLP8 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf48Q5BLP8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf48Q5BLP8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf48Q5BLP8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf48Q5BLP8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf48Q5BLP8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf48Q5BLP8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4orf48Q5BLP8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4orf48Q5BLP8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4orf48Q5BLP8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4orf48Q5BLP8 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4orf48Q5BLP8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4orf48Q5BLP8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf48Q5BLP8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf48Q5BLP8 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf48Q5BLP8 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf48Q5BLP8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf48Q5BLP8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf48Q5BLP8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf48Q5BLP8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf48Q5BLP8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf48Q5BLP8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf48Q5BLP8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf48Q5BLP8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf48Q5BLP8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf48Q5BLP8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf48Q5BLP8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf48Q5BLP8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C4orf48Q5BLP8 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
C4orf48Q5BLP8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C4orf48Q5BLP8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C4orf48Q5BLP8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C4orf48Q5BLP8 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C4orf48Q5BLP8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C4orf48Q5BLP8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C4orf48Q5BLP8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C4orf48Q5BLP8 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf48Q5BLP8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf48Q5BLP8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf48Q5BLP8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C4orf48Q5BLP8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf48Q5BLP8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf48Q5BLP8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf48Q5BLP8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf48Q5BLP8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf48Q5BLP8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf48Q5BLP8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf48Q5BLP8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf48Q5BLP8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf48Q5BLP8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf48Q5BLP8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf48Q5BLP8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf48Q5BLP8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf48Q5BLP8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf48Q5BLP8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf48Q5BLP8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf48Q5BLP8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf48Q5BLP8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf48Q5BLP8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf48Q5BLP8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf48Q5BLP8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf48Q5BLP8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf48Q5BLP8 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf48Q5BLP8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf48Q5BLP8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf48Q5BLP8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf48Q5BLP8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf48Q5BLP8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf48Q5BLP8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf48Q5BLP8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms