Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RNF212Q495C1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RNF212Q495C1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RNF212Q495C1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RNF212Q495C1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RNF212Q495C1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RNF212Q495C1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RNF212Q495C1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RNF212Q495C1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RNF212Q495C1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RNF212Q495C1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RNF212Q495C1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RNF212Q495C1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RNF212Q495C1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RNF212Q495C1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RNF212Q495C1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RNF212Q495C1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RNF212Q495C1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RNF212Q495C1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RNF212Q495C1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RNF212Q495C1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RNF212Q495C1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RNF212Q495C1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RNF212Q495C1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RNF212Q495C1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RNF212Q495C1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RNF212Q495C1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RNF212Q495C1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RNF212Q495C1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RNF212Q495C1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RNF212Q495C1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RNF212Q495C1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RNF212Q495C1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RNF212Q495C1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RNF212Q495C1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RNF212Q495C1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RNF212Q495C1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RNF212Q495C1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RNF212Q495C1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RNF212Q495C1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RNF212Q495C1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
RNF212Q495C1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RNF212Q495C1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RNF212Q495C1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RNF212Q495C1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RNF212Q495C1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RNF212Q495C1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RNF212Q495C1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RNF212Q495C1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RNF212Q495C1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RNF212Q495C1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RNF212Q495C1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RNF212Q495C1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RNF212Q495C1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RNF212Q495C1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RNF212Q495C1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RNF212Q495C1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RNF212Q495C1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RNF212Q495C1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RNF212Q495C1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RNF212Q495C1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RNF212Q495C1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RNF212Q495C1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RNF212Q495C1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RNF212Q495C1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RNF212Q495C1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RNF212Q495C1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RNF212Q495C1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RNF212Q495C1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RNF212Q495C1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RNF212Q495C1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RNF212Q495C1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RNF212Q495C1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNF212Q495C1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNF212Q495C1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNF212Q495C1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNF212Q495C1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNF212Q495C1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNF212Q495C1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNF212Q495C1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNF212Q495C1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RNF212Q495C1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RNF212Q495C1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RNF212Q495C1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF212Q495C1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF212Q495C1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF212Q495C1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF212Q495C1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF212Q495C1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF212Q495C1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF212Q495C1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF212Q495C1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF212Q495C1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF212Q495C1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF212Q495C1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RNF212Q495C1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RNF212Q495C1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RNF212Q495C1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RNF212Q495C1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RNF212Q495C1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms