Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRTAP27-1Q3LI81 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRTAP27-1Q3LI81 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRTAP27-1Q3LI81 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRTAP27-1Q3LI81 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRTAP27-1Q3LI81 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRTAP27-1Q3LI81 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRTAP27-1Q3LI81 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRTAP27-1Q3LI81 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRTAP27-1Q3LI81 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRTAP27-1Q3LI81 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRTAP27-1Q3LI81 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRTAP27-1Q3LI81 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRTAP27-1Q3LI81 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRTAP27-1Q3LI81 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRTAP27-1Q3LI81 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRTAP27-1Q3LI81 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRTAP27-1Q3LI81 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRTAP27-1Q3LI81 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRTAP27-1Q3LI81 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRTAP27-1Q3LI81 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRTAP27-1Q3LI81 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRTAP27-1Q3LI81 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRTAP27-1Q3LI81 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRTAP27-1Q3LI81 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRTAP27-1Q3LI81 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRTAP27-1Q3LI81 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRTAP27-1Q3LI81 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRTAP27-1Q3LI81 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KRTAP27-1Q3LI81 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRTAP27-1Q3LI81 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRTAP27-1Q3LI81 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRTAP27-1Q3LI81 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRTAP27-1Q3LI81 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRTAP27-1Q3LI81 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRTAP27-1Q3LI81 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRTAP27-1Q3LI81 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRTAP27-1Q3LI81 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRTAP27-1Q3LI81 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRTAP27-1Q3LI81 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRTAP27-1Q3LI81 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRTAP27-1Q3LI81 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRTAP27-1Q3LI81 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRTAP27-1Q3LI81 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRTAP27-1Q3LI81 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRTAP27-1Q3LI81 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRTAP27-1Q3LI81 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRTAP27-1Q3LI81 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRTAP27-1Q3LI81 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRTAP27-1Q3LI81 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRTAP27-1Q3LI81 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KRTAP27-1Q3LI81 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KRTAP27-1Q3LI81 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KRTAP27-1Q3LI81 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRTAP27-1Q3LI81 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRTAP27-1Q3LI81 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRTAP27-1Q3LI81 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRTAP27-1Q3LI81 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRTAP27-1Q3LI81 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRTAP27-1Q3LI81 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRTAP27-1Q3LI81 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRTAP27-1Q3LI81 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRTAP27-1Q3LI81 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRTAP27-1Q3LI81 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRTAP27-1Q3LI81 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRTAP27-1Q3LI81 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRTAP27-1Q3LI81 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRTAP27-1Q3LI81 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRTAP27-1Q3LI81 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRTAP27-1Q3LI81 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRTAP27-1Q3LI81 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRTAP27-1Q3LI81 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRTAP27-1Q3LI81 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KRTAP27-1Q3LI81 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRTAP27-1Q3LI81 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRTAP27-1Q3LI81 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRTAP27-1Q3LI81 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRTAP27-1Q3LI81 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRTAP27-1Q3LI81 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRTAP27-1Q3LI81 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRTAP27-1Q3LI81 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRTAP27-1Q3LI81 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRTAP27-1Q3LI81 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRTAP27-1Q3LI81 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRTAP27-1Q3LI81 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRTAP27-1Q3LI81 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRTAP27-1Q3LI81 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRTAP27-1Q3LI81 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRTAP27-1Q3LI81 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KRTAP27-1Q3LI81 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRTAP27-1Q3LI81 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRTAP27-1Q3LI81 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRTAP27-1Q3LI81 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRTAP27-1Q3LI81 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KRTAP27-1Q3LI81 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRTAP27-1Q3LI81 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRTAP27-1Q3LI81 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRTAP27-1Q3LI81 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRTAP27-1Q3LI81 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms