Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HFEQ30201 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HFEQ30201 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HFEQ30201 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HFEQ30201 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HFEQ30201 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HFEQ30201 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HFEQ30201 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HFEQ30201 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HFEQ30201 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HFEQ30201 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HFEQ30201 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HFEQ30201 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HFEQ30201 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HFEQ30201 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HFEQ30201 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HFEQ30201 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HFEQ30201 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HFEQ30201 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HFEQ30201 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HFEQ30201 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HFEQ30201 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HFEQ30201 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HFEQ30201 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HFEQ30201 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HFEQ30201 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HFEQ30201 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HFEQ30201 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HFEQ30201 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HFEQ30201 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HFEQ30201 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HFEQ30201 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HFEQ30201 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HFEQ30201 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HFEQ30201 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HFEQ30201 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HFEQ30201 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HFEQ30201 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HFEQ30201 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HFEQ30201 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HFEQ30201 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HFEQ30201 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HFEQ30201 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HFEQ30201 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HFEQ30201 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HFEQ30201 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HFEQ30201 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HFEQ30201 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HFEQ30201 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HFEQ30201 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HFEQ30201 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HFEQ30201 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HFEQ30201 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HFEQ30201 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HFEQ30201 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HFEQ30201 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HFEQ30201 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HFEQ30201 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HFEQ30201 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HFEQ30201 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HFEQ30201 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HFEQ30201 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HFEQ30201 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HFEQ30201 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HFEQ30201 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HFEQ30201 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HFEQ30201 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HFEQ30201 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HFEQ30201 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HFEQ30201 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HFEQ30201 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HFEQ30201 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HFEQ30201 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HFEQ30201 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HFEQ30201 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HFEQ30201 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HFEQ30201 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HFEQ30201 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HFEQ30201 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HFEQ30201 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HFEQ30201 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HFEQ30201 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HFEQ30201 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HFEQ30201 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HFEQ30201 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HFEQ30201 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HFEQ30201 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HFEQ30201 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HFEQ30201 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HFEQ30201 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HFEQ30201 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HFEQ30201 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HFEQ30201 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HFEQ30201 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HFEQ30201 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HFEQ30201 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HFEQ30201 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HFEQ30201 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HFEQ30201 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HFEQ30201 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 300 ms