Protein–RNA interactions for Protein: Q1AE95

TMEM183B, Transmembrane protein 183B, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM183BQ1AE95 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM183BQ1AE95 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM183BQ1AE95 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM183BQ1AE95 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM183BQ1AE95 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM183BQ1AE95 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM183BQ1AE95 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM183BQ1AE95 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM183BQ1AE95 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM183BQ1AE95 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM183BQ1AE95 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM183BQ1AE95 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM183BQ1AE95 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM183BQ1AE95 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM183BQ1AE95 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM183BQ1AE95 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM183BQ1AE95 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM183BQ1AE95 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM183BQ1AE95 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM183BQ1AE95 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM183BQ1AE95 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM183BQ1AE95 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM183BQ1AE95 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM183BQ1AE95 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM183BQ1AE95 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM183BQ1AE95 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM183BQ1AE95 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM183BQ1AE95 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM183BQ1AE95 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM183BQ1AE95 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM183BQ1AE95 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM183BQ1AE95 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM183BQ1AE95 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM183BQ1AE95 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM183BQ1AE95 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM183BQ1AE95 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM183BQ1AE95 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM183BQ1AE95 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM183BQ1AE95 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM183BQ1AE95 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM183BQ1AE95 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM183BQ1AE95 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM183BQ1AE95 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM183BQ1AE95 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM183BQ1AE95 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM183BQ1AE95 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM183BQ1AE95 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM183BQ1AE95 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM183BQ1AE95 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM183BQ1AE95 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM183BQ1AE95 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM183BQ1AE95 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM183BQ1AE95 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM183BQ1AE95 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM183BQ1AE95 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM183BQ1AE95 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM183BQ1AE95 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM183BQ1AE95 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM183BQ1AE95 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM183BQ1AE95 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM183BQ1AE95 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM183BQ1AE95 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM183BQ1AE95 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM183BQ1AE95 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM183BQ1AE95 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM183BQ1AE95 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM183BQ1AE95 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM183BQ1AE95 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM183BQ1AE95 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM183BQ1AE95 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM183BQ1AE95 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM183BQ1AE95 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM183BQ1AE95 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM183BQ1AE95 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM183BQ1AE95 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM183BQ1AE95 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM183BQ1AE95 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM183BQ1AE95 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM183BQ1AE95 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM183BQ1AE95 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM183BQ1AE95 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM183BQ1AE95 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM183BQ1AE95 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM183BQ1AE95 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM183BQ1AE95 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM183BQ1AE95 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM183BQ1AE95 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM183BQ1AE95 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM183BQ1AE95 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM183BQ1AE95 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM183BQ1AE95 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM183BQ1AE95 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM183BQ1AE95 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM183BQ1AE95 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM183BQ1AE95 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM183BQ1AE95 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM183BQ1AE95 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM183BQ1AE95 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM183BQ1AE95 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM183BQ1AE95 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.7 ms