Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
FSCN1Q16658 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FSCN1Q16658 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FSCN1Q16658 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FSCN1Q16658 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FSCN1Q16658 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FSCN1Q16658 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
FSCN1Q16658 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FSCN1Q16658 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FSCN1Q16658 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FSCN1Q16658 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FSCN1Q16658 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FSCN1Q16658 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FSCN1Q16658 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
FSCN1Q16658 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
FSCN1Q16658 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
FSCN1Q16658 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
FSCN1Q16658 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
FSCN1Q16658 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
FSCN1Q16658 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
FSCN1Q16658 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
FSCN1Q16658 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
FSCN1Q16658 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FSCN1Q16658 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FSCN1Q16658 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FSCN1Q16658 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FSCN1Q16658 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FSCN1Q16658 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FSCN1Q16658 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FSCN1Q16658 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FSCN1Q16658 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FSCN1Q16658 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
FSCN1Q16658 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FSCN1Q16658 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FSCN1Q16658 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FSCN1Q16658 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FSCN1Q16658 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FSCN1Q16658 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FSCN1Q16658 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FSCN1Q16658 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FSCN1Q16658 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FSCN1Q16658 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FSCN1Q16658 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FSCN1Q16658 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FSCN1Q16658 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FSCN1Q16658 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FSCN1Q16658 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FSCN1Q16658 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FSCN1Q16658 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FSCN1Q16658 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FSCN1Q16658 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FSCN1Q16658 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FSCN1Q16658 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FSCN1Q16658 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FSCN1Q16658 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FSCN1Q16658 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FSCN1Q16658 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
FSCN1Q16658 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FSCN1Q16658 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FSCN1Q16658 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FSCN1Q16658 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FSCN1Q16658 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FSCN1Q16658 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FSCN1Q16658 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FSCN1Q16658 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FSCN1Q16658 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
FSCN1Q16658 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
FSCN1Q16658 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FSCN1Q16658 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FSCN1Q16658 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FSCN1Q16658 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FSCN1Q16658 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FSCN1Q16658 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FSCN1Q16658 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FSCN1Q16658 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FSCN1Q16658 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FSCN1Q16658 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FSCN1Q16658 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FSCN1Q16658 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FSCN1Q16658 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FSCN1Q16658 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FSCN1Q16658 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FSCN1Q16658 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FSCN1Q16658 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FSCN1Q16658 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FSCN1Q16658 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FSCN1Q16658 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FSCN1Q16658 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FSCN1Q16658 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FSCN1Q16658 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FSCN1Q16658 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FSCN1Q16658 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FSCN1Q16658 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FSCN1Q16658 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FSCN1Q16658 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FSCN1Q16658 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FSCN1Q16658 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FSCN1Q16658 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FSCN1Q16658 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FSCN1Q16658 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms