Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LY6EQ16553 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LY6EQ16553 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LY6EQ16553 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LY6EQ16553 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LY6EQ16553 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LY6EQ16553 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LY6EQ16553 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LY6EQ16553 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LY6EQ16553 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LY6EQ16553 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LY6EQ16553 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LY6EQ16553 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LY6EQ16553 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LY6EQ16553 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LY6EQ16553 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LY6EQ16553 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LY6EQ16553 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LY6EQ16553 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LY6EQ16553 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LY6EQ16553 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LY6EQ16553 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LY6EQ16553 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LY6EQ16553 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LY6EQ16553 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LY6EQ16553 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LY6EQ16553 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LY6EQ16553 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LY6EQ16553 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LY6EQ16553 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LY6EQ16553 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LY6EQ16553 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LY6EQ16553 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LY6EQ16553 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LY6EQ16553 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LY6EQ16553 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LY6EQ16553 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LY6EQ16553 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LY6EQ16553 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LY6EQ16553 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LY6EQ16553 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LY6EQ16553 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LY6EQ16553 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LY6EQ16553 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LY6EQ16553 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LY6EQ16553 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LY6EQ16553 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LY6EQ16553 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LY6EQ16553 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LY6EQ16553 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LY6EQ16553 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LY6EQ16553 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LY6EQ16553 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LY6EQ16553 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LY6EQ16553 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LY6EQ16553 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LY6EQ16553 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LY6EQ16553 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LY6EQ16553 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LY6EQ16553 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LY6EQ16553 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LY6EQ16553 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LY6EQ16553 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LY6EQ16553 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LY6EQ16553 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LY6EQ16553 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LY6EQ16553 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LY6EQ16553 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LY6EQ16553 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LY6EQ16553 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
LY6EQ16553 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LY6EQ16553 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LY6EQ16553 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LY6EQ16553 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
LY6EQ16553 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
LY6EQ16553 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LY6EQ16553 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
LY6EQ16553 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
LY6EQ16553 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LY6EQ16553 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LY6EQ16553 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LY6EQ16553 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LY6EQ16553 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LY6EQ16553 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LY6EQ16553 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LY6EQ16553 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LY6EQ16553 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LY6EQ16553 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LY6EQ16553 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LY6EQ16553 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LY6EQ16553 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LY6EQ16553 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LY6EQ16553 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LY6EQ16553 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LY6EQ16553 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LY6EQ16553 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LY6EQ16553 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LY6EQ16553 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LY6EQ16553 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LY6EQ16553 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms