Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPE65Q16518 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPE65Q16518 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RPE65Q16518 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPE65Q16518 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPE65Q16518 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPE65Q16518 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPE65Q16518 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPE65Q16518 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPE65Q16518 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPE65Q16518 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RPE65Q16518 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPE65Q16518 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPE65Q16518 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPE65Q16518 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPE65Q16518 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPE65Q16518 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPE65Q16518 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPE65Q16518 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPE65Q16518 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RPE65Q16518 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RPE65Q16518 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPE65Q16518 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPE65Q16518 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPE65Q16518 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPE65Q16518 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPE65Q16518 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPE65Q16518 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPE65Q16518 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RPE65Q16518 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPE65Q16518 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPE65Q16518 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPE65Q16518 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPE65Q16518 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPE65Q16518 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPE65Q16518 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPE65Q16518 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPE65Q16518 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPE65Q16518 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPE65Q16518 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPE65Q16518 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPE65Q16518 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPE65Q16518 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPE65Q16518 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPE65Q16518 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPE65Q16518 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RPE65Q16518 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPE65Q16518 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPE65Q16518 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPE65Q16518 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPE65Q16518 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPE65Q16518 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPE65Q16518 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPE65Q16518 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPE65Q16518 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPE65Q16518 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPE65Q16518 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPE65Q16518 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPE65Q16518 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RPE65Q16518 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPE65Q16518 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPE65Q16518 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPE65Q16518 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPE65Q16518 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPE65Q16518 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPE65Q16518 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPE65Q16518 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RPE65Q16518 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPE65Q16518 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPE65Q16518 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPE65Q16518 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPE65Q16518 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPE65Q16518 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RPE65Q16518 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPE65Q16518 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPE65Q16518 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPE65Q16518 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPE65Q16518 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPE65Q16518 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPE65Q16518 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPE65Q16518 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPE65Q16518 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPE65Q16518 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPE65Q16518 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPE65Q16518 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPE65Q16518 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPE65Q16518 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPE65Q16518 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPE65Q16518 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPE65Q16518 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPE65Q16518 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPE65Q16518 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPE65Q16518 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPE65Q16518 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPE65Q16518 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RPE65Q16518 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPE65Q16518 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPE65Q16518 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPE65Q16518 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPE65Q16518 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
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