Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXT1Q16394 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXT1Q16394 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXT1Q16394 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXT1Q16394 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXT1Q16394 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXT1Q16394 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXT1Q16394 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXT1Q16394 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXT1Q16394 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXT1Q16394 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXT1Q16394 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXT1Q16394 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXT1Q16394 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXT1Q16394 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXT1Q16394 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXT1Q16394 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXT1Q16394 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXT1Q16394 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EXT1Q16394 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXT1Q16394 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXT1Q16394 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXT1Q16394 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXT1Q16394 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXT1Q16394 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXT1Q16394 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXT1Q16394 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXT1Q16394 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXT1Q16394 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXT1Q16394 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EXT1Q16394 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EXT1Q16394 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXT1Q16394 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXT1Q16394 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXT1Q16394 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXT1Q16394 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXT1Q16394 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXT1Q16394 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXT1Q16394 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXT1Q16394 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXT1Q16394 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
EXT1Q16394 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXT1Q16394 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXT1Q16394 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXT1Q16394 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXT1Q16394 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXT1Q16394 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXT1Q16394 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXT1Q16394 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXT1Q16394 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EXT1Q16394 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXT1Q16394 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXT1Q16394 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXT1Q16394 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EXT1Q16394 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXT1Q16394 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXT1Q16394 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXT1Q16394 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXT1Q16394 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXT1Q16394 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXT1Q16394 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXT1Q16394 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXT1Q16394 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EXT1Q16394 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EXT1Q16394 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EXT1Q16394 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXT1Q16394 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
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EXT1Q16394 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXT1Q16394 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXT1Q16394 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXT1Q16394 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXT1Q16394 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXT1Q16394 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXT1Q16394 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXT1Q16394 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXT1Q16394 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXT1Q16394 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EXT1Q16394 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXT1Q16394 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXT1Q16394 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXT1Q16394 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXT1Q16394 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EXT1Q16394 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXT1Q16394 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXT1Q16394 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXT1Q16394 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXT1Q16394 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXT1Q16394 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXT1Q16394 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXT1Q16394 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EXT1Q16394 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EXT1Q16394 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXT1Q16394 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXT1Q16394 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXT1Q16394 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXT1Q16394 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXT1Q16394 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXT1Q16394 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXT1Q16394 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
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