Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC6Q16204 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC6Q16204 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC6Q16204 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC6Q16204 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC6Q16204 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC6Q16204 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC6Q16204 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC6Q16204 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC6Q16204 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC6Q16204 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC6Q16204 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC6Q16204 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC6Q16204 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC6Q16204 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC6Q16204 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC6Q16204 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC6Q16204 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC6Q16204 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC6Q16204 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC6Q16204 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC6Q16204 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC6Q16204 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC6Q16204 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC6Q16204 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC6Q16204 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC6Q16204 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC6Q16204 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC6Q16204 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC6Q16204 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC6Q16204 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC6Q16204 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC6Q16204 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC6Q16204 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC6Q16204 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC6Q16204 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC6Q16204 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC6Q16204 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC6Q16204 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC6Q16204 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC6Q16204 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC6Q16204 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC6Q16204 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC6Q16204 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC6Q16204 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC6Q16204 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC6Q16204 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC6Q16204 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC6Q16204 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC6Q16204 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC6Q16204 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC6Q16204 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC6Q16204 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC6Q16204 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC6Q16204 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC6Q16204 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC6Q16204 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCDC6Q16204 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC6Q16204 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC6Q16204 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC6Q16204 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC6Q16204 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC6Q16204 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC6Q16204 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC6Q16204 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC6Q16204 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC6Q16204 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC6Q16204 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC6Q16204 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC6Q16204 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC6Q16204 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC6Q16204 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC6Q16204 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC6Q16204 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC6Q16204 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC6Q16204 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC6Q16204 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC6Q16204 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC6Q16204 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC6Q16204 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC6Q16204 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC6Q16204 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC6Q16204 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC6Q16204 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC6Q16204 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC6Q16204 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC6Q16204 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC6Q16204 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC6Q16204 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC6Q16204 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC6Q16204 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC6Q16204 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC6Q16204 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC6Q16204 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC6Q16204 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC6Q16204 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC6Q16204 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC6Q16204 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC6Q16204 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC6Q16204 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms