Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC6Q16204 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC6Q16204 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC6Q16204 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC6Q16204 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC6Q16204 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC6Q16204 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC6Q16204 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC6Q16204 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC6Q16204 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC6Q16204 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC6Q16204 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC6Q16204 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC6Q16204 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC6Q16204 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC6Q16204 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC6Q16204 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC6Q16204 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC6Q16204 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC6Q16204 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC6Q16204 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC6Q16204 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC6Q16204 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC6Q16204 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC6Q16204 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC6Q16204 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC6Q16204 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC6Q16204 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC6Q16204 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC6Q16204 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC6Q16204 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC6Q16204 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC6Q16204 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC6Q16204 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC6Q16204 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC6Q16204 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC6Q16204 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC6Q16204 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC6Q16204 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC6Q16204 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC6Q16204 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC6Q16204 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC6Q16204 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC6Q16204 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC6Q16204 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC6Q16204 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC6Q16204 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC6Q16204 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC6Q16204 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC6Q16204 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC6Q16204 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC6Q16204 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC6Q16204 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC6Q16204 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC6Q16204 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC6Q16204 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC6Q16204 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCDC6Q16204 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC6Q16204 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC6Q16204 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC6Q16204 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC6Q16204 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC6Q16204 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC6Q16204 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC6Q16204 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC6Q16204 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC6Q16204 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC6Q16204 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC6Q16204 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC6Q16204 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC6Q16204 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC6Q16204 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC6Q16204 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC6Q16204 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC6Q16204 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC6Q16204 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC6Q16204 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC6Q16204 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC6Q16204 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC6Q16204 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC6Q16204 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC6Q16204 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC6Q16204 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC6Q16204 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC6Q16204 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC6Q16204 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC6Q16204 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC6Q16204 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC6Q16204 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC6Q16204 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC6Q16204 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC6Q16204 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC6Q16204 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC6Q16204 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC6Q16204 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC6Q16204 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC6Q16204 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC6Q16204 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC6Q16204 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC6Q16204 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
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