Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC1A5Q15758 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC1A5Q15758 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC1A5Q15758 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC1A5Q15758 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SLC1A5Q15758 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC1A5Q15758 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC1A5Q15758 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC1A5Q15758 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC1A5Q15758 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC1A5Q15758 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC1A5Q15758 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC1A5Q15758 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC1A5Q15758 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC1A5Q15758 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC1A5Q15758 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC1A5Q15758 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC1A5Q15758 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC1A5Q15758 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC1A5Q15758 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC1A5Q15758 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC1A5Q15758 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC1A5Q15758 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC1A5Q15758 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC1A5Q15758 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC1A5Q15758 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC1A5Q15758 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC1A5Q15758 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC1A5Q15758 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC1A5Q15758 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC1A5Q15758 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC1A5Q15758 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC1A5Q15758 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC1A5Q15758 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC1A5Q15758 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC1A5Q15758 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC1A5Q15758 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC1A5Q15758 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC1A5Q15758 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC1A5Q15758 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC1A5Q15758 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC1A5Q15758 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC1A5Q15758 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC1A5Q15758 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC1A5Q15758 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC1A5Q15758 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC1A5Q15758 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC1A5Q15758 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC1A5Q15758 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC1A5Q15758 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC1A5Q15758 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC1A5Q15758 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC1A5Q15758 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC1A5Q15758 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC1A5Q15758 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC1A5Q15758 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC1A5Q15758 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC1A5Q15758 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC1A5Q15758 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC1A5Q15758 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC1A5Q15758 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC1A5Q15758 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC1A5Q15758 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC1A5Q15758 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC1A5Q15758 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC1A5Q15758 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC1A5Q15758 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC1A5Q15758 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC1A5Q15758 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC1A5Q15758 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC1A5Q15758 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC1A5Q15758 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC1A5Q15758 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC1A5Q15758 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC1A5Q15758 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC1A5Q15758 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC1A5Q15758 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC1A5Q15758 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC1A5Q15758 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC1A5Q15758 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC1A5Q15758 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC1A5Q15758 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC1A5Q15758 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC1A5Q15758 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC1A5Q15758 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC1A5Q15758 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC1A5Q15758 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC1A5Q15758 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC1A5Q15758 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC1A5Q15758 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC1A5Q15758 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC1A5Q15758 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC1A5Q15758 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC1A5Q15758 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC1A5Q15758 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC1A5Q15758 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC1A5Q15758 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC1A5Q15758 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC1A5Q15758 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC1A5Q15758 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms