Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMGN3Q15651 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMGN3Q15651 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMGN3Q15651 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMGN3Q15651 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HMGN3Q15651 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HMGN3Q15651 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HMGN3Q15651 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HMGN3Q15651 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMGN3Q15651 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMGN3Q15651 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HMGN3Q15651 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMGN3Q15651 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMGN3Q15651 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMGN3Q15651 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMGN3Q15651 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMGN3Q15651 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMGN3Q15651 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMGN3Q15651 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMGN3Q15651 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMGN3Q15651 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMGN3Q15651 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGN3Q15651 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGN3Q15651 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGN3Q15651 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGN3Q15651 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGN3Q15651 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGN3Q15651 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGN3Q15651 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGN3Q15651 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGN3Q15651 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGN3Q15651 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGN3Q15651 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGN3Q15651 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGN3Q15651 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGN3Q15651 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGN3Q15651 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGN3Q15651 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGN3Q15651 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGN3Q15651 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGN3Q15651 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGN3Q15651 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGN3Q15651 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGN3Q15651 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGN3Q15651 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HMGN3Q15651 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGN3Q15651 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGN3Q15651 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGN3Q15651 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGN3Q15651 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGN3Q15651 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGN3Q15651 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGN3Q15651 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGN3Q15651 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGN3Q15651 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGN3Q15651 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGN3Q15651 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGN3Q15651 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGN3Q15651 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGN3Q15651 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMGN3Q15651 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMGN3Q15651 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMGN3Q15651 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMGN3Q15651 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMGN3Q15651 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HMGN3Q15651 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
HMGN3Q15651 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMGN3Q15651 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMGN3Q15651 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMGN3Q15651 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMGN3Q15651 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMGN3Q15651 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMGN3Q15651 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMGN3Q15651 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMGN3Q15651 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMGN3Q15651 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMGN3Q15651 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMGN3Q15651 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMGN3Q15651 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMGN3Q15651 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HMGN3Q15651 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMGN3Q15651 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMGN3Q15651 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMGN3Q15651 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMGN3Q15651 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMGN3Q15651 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMGN3Q15651 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMGN3Q15651 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMGN3Q15651 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMGN3Q15651 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMGN3Q15651 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMGN3Q15651 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMGN3Q15651 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMGN3Q15651 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMGN3Q15651 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMGN3Q15651 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMGN3Q15651 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMGN3Q15651 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMGN3Q15651 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HMGN3Q15651 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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