Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TLR1Q15399 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TLR1Q15399 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TLR1Q15399 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TLR1Q15399 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TLR1Q15399 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TLR1Q15399 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TLR1Q15399 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TLR1Q15399 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TLR1Q15399 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TLR1Q15399 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TLR1Q15399 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TLR1Q15399 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TLR1Q15399 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TLR1Q15399 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TLR1Q15399 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TLR1Q15399 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TLR1Q15399 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TLR1Q15399 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TLR1Q15399 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TLR1Q15399 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TLR1Q15399 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TLR1Q15399 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TLR1Q15399 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TLR1Q15399 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TLR1Q15399 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TLR1Q15399 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TLR1Q15399 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TLR1Q15399 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TLR1Q15399 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TLR1Q15399 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TLR1Q15399 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TLR1Q15399 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TLR1Q15399 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TLR1Q15399 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TLR1Q15399 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TLR1Q15399 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TLR1Q15399 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TLR1Q15399 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TLR1Q15399 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TLR1Q15399 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TLR1Q15399 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TLR1Q15399 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TLR1Q15399 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TLR1Q15399 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TLR1Q15399 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TLR1Q15399 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TLR1Q15399 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TLR1Q15399 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TLR1Q15399 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TLR1Q15399 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TLR1Q15399 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TLR1Q15399 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TLR1Q15399 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TLR1Q15399 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TLR1Q15399 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TLR1Q15399 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TLR1Q15399 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TLR1Q15399 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TLR1Q15399 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TLR1Q15399 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TLR1Q15399 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TLR1Q15399 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TLR1Q15399 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TLR1Q15399 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TLR1Q15399 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TLR1Q15399 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TLR1Q15399 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TLR1Q15399 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TLR1Q15399 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TLR1Q15399 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TLR1Q15399 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TLR1Q15399 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLR1Q15399 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLR1Q15399 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLR1Q15399 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TLR1Q15399 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLR1Q15399 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLR1Q15399 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLR1Q15399 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLR1Q15399 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLR1Q15399 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLR1Q15399 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TLR1Q15399 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TLR1Q15399 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TLR1Q15399 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TLR1Q15399 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TLR1Q15399 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLR1Q15399 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLR1Q15399 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLR1Q15399 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLR1Q15399 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLR1Q15399 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLR1Q15399 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TLR1Q15399 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TLR1Q15399 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TLR1Q15399 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TLR1Q15399 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TLR1Q15399 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLR1Q15399 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
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