Protein–RNA interactions for Protein: Q14409

GK3P, Glycerol kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GK3PQ14409 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GK3PQ14409 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GK3PQ14409 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GK3PQ14409 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GK3PQ14409 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GK3PQ14409 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GK3PQ14409 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GK3PQ14409 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GK3PQ14409 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GK3PQ14409 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GK3PQ14409 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GK3PQ14409 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GK3PQ14409 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GK3PQ14409 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GK3PQ14409 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GK3PQ14409 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GK3PQ14409 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GK3PQ14409 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GK3PQ14409 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GK3PQ14409 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GK3PQ14409 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GK3PQ14409 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GK3PQ14409 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GK3PQ14409 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GK3PQ14409 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GK3PQ14409 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GK3PQ14409 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GK3PQ14409 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GK3PQ14409 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GK3PQ14409 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GK3PQ14409 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GK3PQ14409 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GK3PQ14409 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GK3PQ14409 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GK3PQ14409 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GK3PQ14409 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GK3PQ14409 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GK3PQ14409 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GK3PQ14409 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GK3PQ14409 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GK3PQ14409 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GK3PQ14409 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GK3PQ14409 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GK3PQ14409 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GK3PQ14409 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GK3PQ14409 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GK3PQ14409 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GK3PQ14409 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GK3PQ14409 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GK3PQ14409 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GK3PQ14409 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GK3PQ14409 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GK3PQ14409 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GK3PQ14409 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GK3PQ14409 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GK3PQ14409 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GK3PQ14409 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GK3PQ14409 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GK3PQ14409 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GK3PQ14409 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GK3PQ14409 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GK3PQ14409 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GK3PQ14409 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GK3PQ14409 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GK3PQ14409 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GK3PQ14409 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GK3PQ14409 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GK3PQ14409 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GK3PQ14409 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GK3PQ14409 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GK3PQ14409 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GK3PQ14409 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GK3PQ14409 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GK3PQ14409 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GK3PQ14409 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GK3PQ14409 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GK3PQ14409 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GK3PQ14409 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GK3PQ14409 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GK3PQ14409 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GK3PQ14409 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GK3PQ14409 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GK3PQ14409 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GK3PQ14409 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GK3PQ14409 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GK3PQ14409 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GK3PQ14409 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GK3PQ14409 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GK3PQ14409 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GK3PQ14409 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GK3PQ14409 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GK3PQ14409 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GK3PQ14409 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GK3PQ14409 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GK3PQ14409 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GK3PQ14409 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GK3PQ14409 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GK3PQ14409 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GK3PQ14409 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GK3PQ14409 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms