Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CSHL1Q14406 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSHL1Q14406 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSHL1Q14406 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSHL1Q14406 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSHL1Q14406 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSHL1Q14406 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CSHL1Q14406 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSHL1Q14406 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSHL1Q14406 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSHL1Q14406 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSHL1Q14406 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSHL1Q14406 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSHL1Q14406 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSHL1Q14406 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSHL1Q14406 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSHL1Q14406 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSHL1Q14406 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSHL1Q14406 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSHL1Q14406 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CSHL1Q14406 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSHL1Q14406 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSHL1Q14406 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSHL1Q14406 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSHL1Q14406 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSHL1Q14406 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSHL1Q14406 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSHL1Q14406 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CSHL1Q14406 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSHL1Q14406 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSHL1Q14406 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSHL1Q14406 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CSHL1Q14406 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CSHL1Q14406 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CSHL1Q14406 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CSHL1Q14406 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSHL1Q14406 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSHL1Q14406 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSHL1Q14406 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSHL1Q14406 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSHL1Q14406 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSHL1Q14406 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSHL1Q14406 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSHL1Q14406 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSHL1Q14406 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSHL1Q14406 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSHL1Q14406 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSHL1Q14406 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSHL1Q14406 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSHL1Q14406 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSHL1Q14406 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSHL1Q14406 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSHL1Q14406 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSHL1Q14406 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSHL1Q14406 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSHL1Q14406 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSHL1Q14406 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSHL1Q14406 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSHL1Q14406 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSHL1Q14406 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSHL1Q14406 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSHL1Q14406 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSHL1Q14406 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSHL1Q14406 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSHL1Q14406 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSHL1Q14406 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSHL1Q14406 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSHL1Q14406 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSHL1Q14406 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSHL1Q14406 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSHL1Q14406 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSHL1Q14406 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CSHL1Q14406 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSHL1Q14406 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSHL1Q14406 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSHL1Q14406 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSHL1Q14406 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSHL1Q14406 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSHL1Q14406 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSHL1Q14406 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSHL1Q14406 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSHL1Q14406 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSHL1Q14406 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CSHL1Q14406 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSHL1Q14406 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSHL1Q14406 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSHL1Q14406 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSHL1Q14406 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSHL1Q14406 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSHL1Q14406 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSHL1Q14406 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSHL1Q14406 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSHL1Q14406 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSHL1Q14406 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CSHL1Q14406 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CSHL1Q14406 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSHL1Q14406 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSHL1Q14406 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSHL1Q14406 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSHL1Q14406 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms