Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPIDRQ14159 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPIDRQ14159 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPIDRQ14159 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SPIDRQ14159 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPIDRQ14159 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPIDRQ14159 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPIDRQ14159 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPIDRQ14159 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPIDRQ14159 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPIDRQ14159 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPIDRQ14159 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPIDRQ14159 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPIDRQ14159 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPIDRQ14159 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPIDRQ14159 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPIDRQ14159 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPIDRQ14159 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SPIDRQ14159 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPIDRQ14159 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPIDRQ14159 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPIDRQ14159 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPIDRQ14159 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPIDRQ14159 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPIDRQ14159 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPIDRQ14159 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPIDRQ14159 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPIDRQ14159 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPIDRQ14159 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPIDRQ14159 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPIDRQ14159 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPIDRQ14159 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPIDRQ14159 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPIDRQ14159 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPIDRQ14159 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPIDRQ14159 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPIDRQ14159 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPIDRQ14159 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPIDRQ14159 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPIDRQ14159 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPIDRQ14159 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPIDRQ14159 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SPIDRQ14159 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPIDRQ14159 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPIDRQ14159 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPIDRQ14159 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPIDRQ14159 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPIDRQ14159 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPIDRQ14159 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPIDRQ14159 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPIDRQ14159 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPIDRQ14159 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SPIDRQ14159 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SPIDRQ14159 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPIDRQ14159 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPIDRQ14159 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPIDRQ14159 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SPIDRQ14159 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPIDRQ14159 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPIDRQ14159 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPIDRQ14159 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPIDRQ14159 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPIDRQ14159 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPIDRQ14159 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPIDRQ14159 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SPIDRQ14159 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPIDRQ14159 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SPIDRQ14159 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPIDRQ14159 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SPIDRQ14159 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPIDRQ14159 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPIDRQ14159 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPIDRQ14159 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPIDRQ14159 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SPIDRQ14159 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SPIDRQ14159 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SPIDRQ14159 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPIDRQ14159 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPIDRQ14159 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPIDRQ14159 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPIDRQ14159 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPIDRQ14159 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPIDRQ14159 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPIDRQ14159 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPIDRQ14159 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPIDRQ14159 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPIDRQ14159 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPIDRQ14159 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPIDRQ14159 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPIDRQ14159 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPIDRQ14159 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPIDRQ14159 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPIDRQ14159 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPIDRQ14159 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPIDRQ14159 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPIDRQ14159 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPIDRQ14159 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SPIDRQ14159 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPIDRQ14159 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SPIDRQ14159 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
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