Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRR1Q13601 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRR1Q13601 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRR1Q13601 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRR1Q13601 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRR1Q13601 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRR1Q13601 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRR1Q13601 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRR1Q13601 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRR1Q13601 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRR1Q13601 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRR1Q13601 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
KRR1Q13601 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRR1Q13601 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRR1Q13601 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRR1Q13601 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRR1Q13601 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRR1Q13601 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRR1Q13601 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRR1Q13601 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRR1Q13601 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRR1Q13601 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRR1Q13601 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRR1Q13601 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
KRR1Q13601 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRR1Q13601 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
KRR1Q13601 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRR1Q13601 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRR1Q13601 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRR1Q13601 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRR1Q13601 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRR1Q13601 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRR1Q13601 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRR1Q13601 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRR1Q13601 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRR1Q13601 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRR1Q13601 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRR1Q13601 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRR1Q13601 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRR1Q13601 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRR1Q13601 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRR1Q13601 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRR1Q13601 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRR1Q13601 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRR1Q13601 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KRR1Q13601 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRR1Q13601 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRR1Q13601 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRR1Q13601 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRR1Q13601 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRR1Q13601 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRR1Q13601 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRR1Q13601 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRR1Q13601 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRR1Q13601 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRR1Q13601 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRR1Q13601 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRR1Q13601 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRR1Q13601 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRR1Q13601 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRR1Q13601 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRR1Q13601 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRR1Q13601 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRR1Q13601 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRR1Q13601 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRR1Q13601 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRR1Q13601 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRR1Q13601 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRR1Q13601 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRR1Q13601 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRR1Q13601 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRR1Q13601 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRR1Q13601 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRR1Q13601 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRR1Q13601 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRR1Q13601 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRR1Q13601 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRR1Q13601 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRR1Q13601 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRR1Q13601 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRR1Q13601 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRR1Q13601 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRR1Q13601 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRR1Q13601 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRR1Q13601 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRR1Q13601 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRR1Q13601 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRR1Q13601 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRR1Q13601 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRR1Q13601 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRR1Q13601 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRR1Q13601 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRR1Q13601 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRR1Q13601 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRR1Q13601 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRR1Q13601 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRR1Q13601 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRR1Q13601 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRR1Q13601 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRR1Q13601 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
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