Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

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Length 666 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CAMK2BQ13554 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CAMK2BQ13554 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CAMK2BQ13554 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CAMK2BQ13554 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CAMK2BQ13554 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAMK2BQ13554 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAMK2BQ13554 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAMK2BQ13554 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAMK2BQ13554 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAMK2BQ13554 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAMK2BQ13554 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAMK2BQ13554 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CAMK2BQ13554 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAMK2BQ13554 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAMK2BQ13554 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAMK2BQ13554 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAMK2BQ13554 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAMK2BQ13554 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAMK2BQ13554 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAMK2BQ13554 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAMK2BQ13554 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAMK2BQ13554 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CAMK2BQ13554 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAMK2BQ13554 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAMK2BQ13554 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CAMK2BQ13554 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAMK2BQ13554 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAMK2BQ13554 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAMK2BQ13554 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAMK2BQ13554 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAMK2BQ13554 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAMK2BQ13554 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAMK2BQ13554 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAMK2BQ13554 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAMK2BQ13554 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAMK2BQ13554 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAMK2BQ13554 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAMK2BQ13554 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAMK2BQ13554 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAMK2BQ13554 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAMK2BQ13554 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAMK2BQ13554 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAMK2BQ13554 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAMK2BQ13554 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAMK2BQ13554 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAMK2BQ13554 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAMK2BQ13554 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAMK2BQ13554 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAMK2BQ13554 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAMK2BQ13554 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAMK2BQ13554 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAMK2BQ13554 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAMK2BQ13554 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAMK2BQ13554 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAMK2BQ13554 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAMK2BQ13554 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAMK2BQ13554 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAMK2BQ13554 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAMK2BQ13554 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAMK2BQ13554 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAMK2BQ13554 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CAMK2BQ13554 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAMK2BQ13554 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAMK2BQ13554 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAMK2BQ13554 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAMK2BQ13554 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAMK2BQ13554 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CAMK2BQ13554 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMK2BQ13554 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMK2BQ13554 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMK2BQ13554 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMK2BQ13554 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMK2BQ13554 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMK2BQ13554 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMK2BQ13554 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMK2BQ13554 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMK2BQ13554 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMK2BQ13554 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMK2BQ13554 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMK2BQ13554 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMK2BQ13554 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMK2BQ13554 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMK2BQ13554 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMK2BQ13554 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMK2BQ13554 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMK2BQ13554 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAMK2BQ13554 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAMK2BQ13554 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAMK2BQ13554 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAMK2BQ13554 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAMK2BQ13554 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAMK2BQ13554 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMK2BQ13554 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMK2BQ13554 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAMK2BQ13554 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAMK2BQ13554 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAMK2BQ13554 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAMK2BQ13554 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAMK2BQ13554 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
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