Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
BFSP2Q13515 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
BFSP2Q13515 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
BFSP2Q13515 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BFSP2Q13515 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BFSP2Q13515 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BFSP2Q13515 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BFSP2Q13515 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BFSP2Q13515 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BFSP2Q13515 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BFSP2Q13515 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BFSP2Q13515 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BFSP2Q13515 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BFSP2Q13515 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BFSP2Q13515 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BFSP2Q13515 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BFSP2Q13515 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BFSP2Q13515 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BFSP2Q13515 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BFSP2Q13515 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BFSP2Q13515 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BFSP2Q13515 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BFSP2Q13515 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BFSP2Q13515 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BFSP2Q13515 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BFSP2Q13515 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BFSP2Q13515 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
BFSP2Q13515 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BFSP2Q13515 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
BFSP2Q13515 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BFSP2Q13515 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BFSP2Q13515 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BFSP2Q13515 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BFSP2Q13515 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BFSP2Q13515 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BFSP2Q13515 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BFSP2Q13515 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BFSP2Q13515 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BFSP2Q13515 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BFSP2Q13515 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BFSP2Q13515 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BFSP2Q13515 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BFSP2Q13515 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BFSP2Q13515 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BFSP2Q13515 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BFSP2Q13515 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BFSP2Q13515 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BFSP2Q13515 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BFSP2Q13515 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BFSP2Q13515 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BFSP2Q13515 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BFSP2Q13515 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BFSP2Q13515 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BFSP2Q13515 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BFSP2Q13515 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BFSP2Q13515 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BFSP2Q13515 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BFSP2Q13515 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BFSP2Q13515 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
BFSP2Q13515 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BFSP2Q13515 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BFSP2Q13515 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BFSP2Q13515 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BFSP2Q13515 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BFSP2Q13515 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
BFSP2Q13515 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
BFSP2Q13515 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BFSP2Q13515 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BFSP2Q13515 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BFSP2Q13515 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BFSP2Q13515 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BFSP2Q13515 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BFSP2Q13515 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BFSP2Q13515 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BFSP2Q13515 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BFSP2Q13515 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BFSP2Q13515 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
BFSP2Q13515 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
BFSP2Q13515 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
BFSP2Q13515 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
BFSP2Q13515 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BFSP2Q13515 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BFSP2Q13515 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BFSP2Q13515 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BFSP2Q13515 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BFSP2Q13515 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BFSP2Q13515 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BFSP2Q13515 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BFSP2Q13515 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BFSP2Q13515 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BFSP2Q13515 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BFSP2Q13515 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BFSP2Q13515 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BFSP2Q13515 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BFSP2Q13515 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BFSP2Q13515 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BFSP2Q13515 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
BFSP2Q13515 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
BFSP2Q13515 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BFSP2Q13515 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
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