Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBB3Q13509 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBB3Q13509 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBB3Q13509 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBB3Q13509 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBB3Q13509 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBB3Q13509 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBB3Q13509 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBB3Q13509 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBB3Q13509 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBB3Q13509 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBB3Q13509 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBB3Q13509 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBB3Q13509 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBB3Q13509 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBB3Q13509 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBB3Q13509 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBB3Q13509 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBB3Q13509 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBB3Q13509 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBB3Q13509 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBB3Q13509 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBB3Q13509 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBB3Q13509 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBB3Q13509 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBB3Q13509 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBB3Q13509 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBB3Q13509 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBB3Q13509 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBB3Q13509 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBB3Q13509 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBB3Q13509 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBB3Q13509 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBB3Q13509 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBB3Q13509 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBB3Q13509 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBB3Q13509 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBB3Q13509 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TUBB3Q13509 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
TUBB3Q13509 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TUBB3Q13509 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TUBB3Q13509 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
TUBB3Q13509 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TUBB3Q13509 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TUBB3Q13509 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBB3Q13509 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBB3Q13509 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBB3Q13509 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBB3Q13509 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBB3Q13509 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBB3Q13509 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBB3Q13509 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBB3Q13509 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBB3Q13509 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBB3Q13509 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBB3Q13509 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBB3Q13509 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBB3Q13509 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBB3Q13509 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBB3Q13509 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBB3Q13509 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBB3Q13509 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBB3Q13509 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBB3Q13509 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBB3Q13509 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBB3Q13509 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBB3Q13509 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBB3Q13509 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBB3Q13509 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBB3Q13509 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBB3Q13509 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBB3Q13509 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBB3Q13509 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBB3Q13509 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBB3Q13509 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBB3Q13509 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBB3Q13509 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBB3Q13509 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBB3Q13509 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBB3Q13509 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBB3Q13509 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TUBB3Q13509 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBB3Q13509 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBB3Q13509 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBB3Q13509 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBB3Q13509 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBB3Q13509 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBB3Q13509 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBB3Q13509 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBB3Q13509 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBB3Q13509 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBB3Q13509 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBB3Q13509 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBB3Q13509 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBB3Q13509 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBB3Q13509 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBB3Q13509 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBB3Q13509 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBB3Q13509 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBB3Q13509 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
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