Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IKZF1Q13422 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IKZF1Q13422 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IKZF1Q13422 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IKZF1Q13422 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IKZF1Q13422 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IKZF1Q13422 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IKZF1Q13422 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IKZF1Q13422 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IKZF1Q13422 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IKZF1Q13422 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IKZF1Q13422 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IKZF1Q13422 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IKZF1Q13422 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IKZF1Q13422 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IKZF1Q13422 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IKZF1Q13422 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IKZF1Q13422 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IKZF1Q13422 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IKZF1Q13422 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IKZF1Q13422 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IKZF1Q13422 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IKZF1Q13422 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IKZF1Q13422 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IKZF1Q13422 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IKZF1Q13422 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IKZF1Q13422 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IKZF1Q13422 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IKZF1Q13422 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IKZF1Q13422 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IKZF1Q13422 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IKZF1Q13422 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IKZF1Q13422 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IKZF1Q13422 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IKZF1Q13422 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IKZF1Q13422 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IKZF1Q13422 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IKZF1Q13422 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IKZF1Q13422 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IKZF1Q13422 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IKZF1Q13422 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IKZF1Q13422 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IKZF1Q13422 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IKZF1Q13422 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IKZF1Q13422 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IKZF1Q13422 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IKZF1Q13422 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IKZF1Q13422 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IKZF1Q13422 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IKZF1Q13422 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IKZF1Q13422 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IKZF1Q13422 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IKZF1Q13422 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IKZF1Q13422 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IKZF1Q13422 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IKZF1Q13422 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IKZF1Q13422 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IKZF1Q13422 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IKZF1Q13422 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IKZF1Q13422 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IKZF1Q13422 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IKZF1Q13422 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IKZF1Q13422 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IKZF1Q13422 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IKZF1Q13422 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IKZF1Q13422 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IKZF1Q13422 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IKZF1Q13422 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IKZF1Q13422 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IKZF1Q13422 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IKZF1Q13422 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IKZF1Q13422 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IKZF1Q13422 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IKZF1Q13422 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IKZF1Q13422 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms