Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX3Q13185 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX3Q13185 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX3Q13185 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX3Q13185 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX3Q13185 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX3Q13185 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBX3Q13185 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBX3Q13185 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBX3Q13185 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBX3Q13185 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX3Q13185 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX3Q13185 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX3Q13185 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX3Q13185 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX3Q13185 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBX3Q13185 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBX3Q13185 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBX3Q13185 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX3Q13185 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX3Q13185 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX3Q13185 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBX3Q13185 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBX3Q13185 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBX3Q13185 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBX3Q13185 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBX3Q13185 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX3Q13185 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX3Q13185 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX3Q13185 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX3Q13185 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX3Q13185 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX3Q13185 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX3Q13185 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX3Q13185 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX3Q13185 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX3Q13185 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX3Q13185 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX3Q13185 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBX3Q13185 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBX3Q13185 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBX3Q13185 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBX3Q13185 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX3Q13185 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX3Q13185 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX3Q13185 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX3Q13185 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX3Q13185 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX3Q13185 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX3Q13185 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX3Q13185 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX3Q13185 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX3Q13185 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX3Q13185 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBX3Q13185 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBX3Q13185 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBX3Q13185 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBX3Q13185 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBX3Q13185 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBX3Q13185 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBX3Q13185 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX3Q13185 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX3Q13185 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX3Q13185 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBX3Q13185 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBX3Q13185 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX3Q13185 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX3Q13185 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX3Q13185 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CBX3Q13185 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX3Q13185 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX3Q13185 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX3Q13185 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX3Q13185 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX3Q13185 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX3Q13185 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX3Q13185 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX3Q13185 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX3Q13185 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX3Q13185 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBX3Q13185 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBX3Q13185 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBX3Q13185 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBX3Q13185 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX3Q13185 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX3Q13185 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX3Q13185 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBX3Q13185 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBX3Q13185 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBX3Q13185 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBX3Q13185 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
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