Protein–RNA interactions for Protein: Q12297

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, yeastyeast

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TAF3Q12297 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt8.66□□□□□ -1.02
TAF3Q12297 SNX3YOR357C 489 nt8.66□□□□□ -1.02
TAF3Q12297 YRF1-2YER190W 5046 nt8.66□□□□□ -1.02
TAF3Q12297 MAS1YLR163C 1389 nt8.65□□□□□ -1.02
TAF3Q12297 TSC10YBR265W 963 nt8.65□□□□□ -1.02
TAF3Q12297 TPN1YGL186C 1740 nt8.65□□□□□ -1.03
TAF3Q12297 APT2YDR441C 546 nt8.64□□□□□ -1.03
TAF3Q12297 TOM71YHR117W 1920 nt8.64□□□□□ -1.03
TAF3Q12297 KRR1YCL059C 951 nt8.63□□□□□ -1.03
TAF3Q12297 YGL034CYGL034C 366 nt8.63□□□□□ -1.03
TAF3Q12297 YLR279WYLR279W 390 nt8.63□□□□□ -1.03
TAF3Q12297 LEU4YNL104C 1860 nt8.63□□□□□ -1.03
TAF3Q12297 MDL2YPL270W 2322 nt8.62□□□□□ -1.03
TAF3Q12297 DPL1YDR294C 1770 nt8.62□□□□□ -1.03
TAF3Q12297 YDR455CYDR455C 309 nt8.6□□□□□ -1.03
TAF3Q12297 MSB4YOL112W 1479 nt8.59□□□□□ -1.03
TAF3Q12297 LSM5YER146W 282 nt8.59□□□□□ -1.03
TAF3Q12297 NSG2YNL156C 900 nt8.59□□□□□ -1.03
TAF3Q12297 FCY21YER060W 1587 nt8.59□□□□□ -1.03
TAF3Q12297 CSM1YCR086W 573 nt8.58□□□□□ -1.04
TAF3Q12297 NAT4YMR069W 858 nt8.57□□□□□ -1.04
TAF3Q12297 NPP2YEL016C 1482 nt8.57□□□□□ -1.04
TAF3Q12297 FET5YFL041W 1869 nt8.56□□□□□ -1.04
TAF3Q12297 YDR467CYDR467C 327 nt8.56□□□□□ -1.04
TAF3Q12297 SDH5YOL071W 489 nt8.56□□□□□ -1.04
TAF3Q12297 LSB5YCL034W 1065 nt8.56□□□□□ -1.04
TAF3Q12297 PAU16YKL224C 372 nt8.55□□□□□ -1.04
TAF3Q12297 ERG13YML126C 1476 nt8.55□□□□□ -1.04
TAF3Q12297 YGR012WYGR012W 1182 nt8.54□□□□□ -1.04
TAF3Q12297 HBS1YKR084C 1836 nt8.54□□□□□ -1.04
TAF3Q12297 YLR173WYLR173W 1827 nt8.54□□□□□ -1.04
TAF3Q12297 SFL1YOR140W 2301 nt8.53□□□□□ -1.04
TAF3Q12297 OYE2YHR179W 1203 nt8.53□□□□□ -1.04
TAF3Q12297 RBG1YAL036C 1110 nt8.53□□□□□ -1.04
TAF3Q12297 EAF3YPR023C 1206 nt8.53□□□□□ -1.04
TAF3Q12297 ALR1YOL130W 2580 nt8.52□□□□□ -1.05
TAF3Q12297 DAK2YFL053W 1776 nt8.52□□□□□ -1.05
TAF3Q12297 PRY1YJL079C 900 nt8.51□□□□□ -1.05
TAF3Q12297 GNP1YDR508C 1992 nt8.51□□□□□ -1.05
TAF3Q12297 GND1YHR183W 1470 nt8.51□□□□□ -1.05
TAF3Q12297 UFD1YGR048W 1086 nt8.5□□□□□ -1.05
TAF3Q12297 CSM2YIL132C 642 nt8.5□□□□□ -1.05
TAF3Q12297 RPT5YOR117W 1305 nt8.5□□□□□ -1.05
TAF3Q12297 TRP2YER090W 1524 nt8.49□□□□□ -1.05
TAF3Q12297 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt8.49□□□□□ -1.05
TAF3Q12297 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt8.49□□□□□ -1.05
TAF3Q12297 SAC7YDR389W 1965 nt8.48□□□□□ -1.05
TAF3Q12297 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt8.48□□□□□ -1.05
TAF3Q12297 DDI1YER143W 1287 nt8.48□□□□□ -1.05
TAF3Q12297 ELO1YJL196C 933 nt8.48□□□□□ -1.05
TAF3Q12297 ORT1YOR130C 879 nt8.48□□□□□ -1.05
TAF3Q12297 YMR265CYMR265C 1386 nt8.48□□□□□ -1.05
TAF3Q12297 YDR094WYDR094W 336 nt8.47□□□□□ -1.05
TAF3Q12297 SAM3YPL274W 1764 nt8.47□□□□□ -1.05
TAF3Q12297 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt8.46□□□□□ -1.06
TAF3Q12297 TPS1YBR126C 1488 nt8.45□□□□□ -1.06
TAF3Q12297 DUR3YHL016C 2208 nt8.45□□□□□ -1.06
TAF3Q12297 FIT1YDR534C 1587 nt8.45□□□□□ -1.06
TAF3Q12297 THI6YPL214C 1623 nt8.45□□□□□ -1.06
TAF3Q12297 snR4snR4 186 nt8.45□□□□□ -1.06
TAF3Q12297 RPN14YGL004C 1254 nt8.44□□□□□ -1.06
TAF3Q12297 HAP5YOR358W 729 nt8.44□□□□□ -1.06
TAF3Q12297 SMM1YNR015W 1155 nt8.43□□□□□ -1.06
TAF3Q12297 YJL118WYJL118W 660 nt8.42□□□□□ -1.06
TAF3Q12297 EMC3YKL207W 762 nt8.42□□□□□ -1.06
TAF3Q12297 RTG2YGL252C 1767 nt8.42□□□□□ -1.06
TAF3Q12297 LOT5YKL183W 921 nt8.41□□□□□ -1.06
TAF3Q12297 YNR064CYNR064C 873 nt8.41□□□□□ -1.06
TAF3Q12297 HXT11YOL156W 1704 nt8.4□□□□□ -1.06
TAF3Q12297 YBL095WYBL095W 813 nt8.4□□□□□ -1.06
TAF3Q12297 DUS3YLR401C 2007 nt8.39□□□□□ -1.07
TAF3Q12297 AAT1YKL106W 1356 nt8.39□□□□□ -1.07
TAF3Q12297 GPM1YKL152C 744 nt8.38□□□□□ -1.07
TAF3Q12297 TMA23YMR269W 636 nt8.38□□□□□ -1.07
TAF3Q12297 YMC2YBR104W 990 nt8.38□□□□□ -1.07
TAF3Q12297 POP2YNR052C 1302 nt8.37□□□□□ -1.07
TAF3Q12297 RRT8YOL048C 1029 nt8.37□□□□□ -1.07
TAF3Q12297 LPD1YFL018C 1500 nt8.37□□□□□ -1.07
TAF3Q12297 KEL3YPL263C 1956 nt8.37□□□□□ -1.07
TAF3Q12297 SUV3YPL029W 2214 nt8.37□□□□□ -1.07
TAF3Q12297 SRM1YGL097W 1449 nt8.37□□□□□ -1.07
TAF3Q12297 HXT12YIL170W 1374 nt8.36□□□□□ -1.07
TAF3Q12297 ADE16YLR028C 1776 nt8.36□□□□□ -1.07
TAF3Q12297 YJR114WYJR114W 393 nt8.35□□□□□ -1.07
TAF3Q12297 ADE8YDR408C 645 nt8.34□□□□□ -1.07
TAF3Q12297 YJL055WYJL055W 738 nt8.34□□□□□ -1.07
TAF3Q12297 SNU66YOR308C 1764 nt8.34□□□□□ -1.07
TAF3Q12297 GCD11YER025W 1584 nt8.33□□□□□ -1.08
TAF3Q12297 IMO32YGR031W 1029 nt8.33□□□□□ -1.08
TAF3Q12297 RIB7YBR153W 735 nt8.32□□□□□ -1.08
TAF3Q12297 RAD23YEL037C 1197 nt8.31□□□□□ -1.08
TAF3Q12297 VRG4YGL225W 1014 nt8.31□□□□□ -1.08
TAF3Q12297 CRC1YOR100C 984 nt8.31□□□□□ -1.08
TAF3Q12297 snR31snR31 225 nt8.31□□□□□ -1.08
TAF3Q12297 FTH1YBR207W 1398 nt8.31□□□□□ -1.08
TAF3Q12297 ADE2YOR128C 1716 nt8.3□□□□□ -1.08
TAF3Q12297 YMR210WYMR210W 1350 nt8.29□□□□□ -1.08
TAF3Q12297 LSB3YFR024C-A 1380 nt8.27□□□□□ -1.09
TAF3Q12297 OPI3YJR073C 621 nt8.26□□□□□ -1.09
TAF3Q12297 PFS2YNL317W 1398 nt8.25□□□□□ -1.09
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