Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 BEM1YBR200W 1656 nt8.61□□□□□ -1.03
NFI1Q12216 DLD2YDL178W 1593 nt8.6□□□□□ -1.03
NFI1Q12216 PUS7YOR243C 2031 nt8.59□□□□□ -1.03
NFI1Q12216 SEC61YLR378C 1443 nt8.59□□□□□ -1.03
NFI1Q12216 VPS62YGR141W 1404 nt8.58□□□□□ -1.04
NFI1Q12216 BNI5YNL166C 1347 nt8.56□□□□□ -1.04
NFI1Q12216 SSL2YIL143C 2532 nt8.56□□□□□ -1.04
NFI1Q12216 OXA1YER154W 1209 nt8.56□□□□□ -1.04
NFI1Q12216 MDM35YKL053C-A 261 nt8.56□□□□□ -1.04
NFI1Q12216 HBS1YKR084C 1836 nt8.56□□□□□ -1.04
NFI1Q12216 FCY21YER060W 1587 nt8.56□□□□□ -1.04
NFI1Q12216 PHO23YNL097C 993 nt8.55□□□□□ -1.04
NFI1Q12216 CTF3YLR381W 2202 nt8.55□□□□□ -1.04
NFI1Q12216 GGC1YDL198C 903 nt8.54□□□□□ -1.04
NFI1Q12216 AFG2YLR397C 2343 nt8.53□□□□□ -1.04
NFI1Q12216 YDL086WYDL086W 822 nt8.53□□□□□ -1.04
NFI1Q12216 HEM13YDR044W 987 nt8.53□□□□□ -1.04
NFI1Q12216 APT2YDR441C 546 nt8.53□□□□□ -1.04
NFI1Q12216 POP2YNR052C 1302 nt8.53□□□□□ -1.04
NFI1Q12216 YER188WYER188W 720 nt8.52□□□□□ -1.05
NFI1Q12216 MSC1YML128C 1542 nt8.52□□□□□ -1.05
NFI1Q12216 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt8.51□□□□□ -1.05
NFI1Q12216 FUB1YCR076C 753 nt8.5□□□□□ -1.05
NFI1Q12216 RAD23YEL037C 1197 nt8.5□□□□□ -1.05
NFI1Q12216 AGP3YFL055W 1677 nt8.49□□□□□ -1.05
NFI1Q12216 CAB5YDR196C 726 nt8.49□□□□□ -1.05
NFI1Q12216 CSM1YCR086W 573 nt8.48□□□□□ -1.05
NFI1Q12216 PRY1YJL079C 900 nt8.48□□□□□ -1.05
NFI1Q12216 YEL023CYEL023C 2049 nt8.47□□□□□ -1.05
NFI1Q12216 YIL108WYIL108W 2091 nt8.47□□□□□ -1.05
NFI1Q12216 DIG1YPL049C 1359 nt8.47□□□□□ -1.05
NFI1Q12216 GLR1YPL091W 1452 nt8.46□□□□□ -1.05
NFI1Q12216 YLR111WYLR111W 333 nt8.46□□□□□ -1.06
NFI1Q12216 AIM34YMR003W 597 nt8.46□□□□□ -1.06
NFI1Q12216 SMM1YNR015W 1155 nt8.46□□□□□ -1.06
NFI1Q12216 OSH7YHR001W 1314 nt8.46□□□□□ -1.06
NFI1Q12216 NUC1YJL208C 990 nt8.45□□□□□ -1.06
NFI1Q12216 GID8YMR135C 1368 nt8.45□□□□□ -1.06
NFI1Q12216 RIB3YDR487C 627 nt8.44□□□□□ -1.06
NFI1Q12216 TAT2YOL020W 1779 nt8.43□□□□□ -1.06
NFI1Q12216 RAS2YNL098C 969 nt8.43□□□□□ -1.06
NFI1Q12216 GND1YHR183W 1470 nt8.43□□□□□ -1.06
NFI1Q12216 TOP3YLR234W 1971 nt8.41□□□□□ -1.06
NFI1Q12216 MRS6YOR370C 1812 nt8.41□□□□□ -1.06
NFI1Q12216 AIM1YAL046C 357 nt8.4□□□□□ -1.06
NFI1Q12216 SAM3YPL274W 1764 nt8.4□□□□□ -1.07
NFI1Q12216 SOL2YCR073W-A 948 nt8.39□□□□□ -1.07
NFI1Q12216 LOT5YKL183W 921 nt8.39□□□□□ -1.07
NFI1Q12216 YKL133CYKL133C 1392 nt8.38□□□□□ -1.07
NFI1Q12216 CHA1YCL064C 1083 nt8.38□□□□□ -1.07
NFI1Q12216 FET5YFL041W 1869 nt8.38□□□□□ -1.07
NFI1Q12216 ADE16YLR028C 1776 nt8.38□□□□□ -1.07
NFI1Q12216 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt8.37□□□□□ -1.07
NFI1Q12216 LSM5YER146W 282 nt8.36□□□□□ -1.07
NFI1Q12216 GUT1YHL032C 2130 nt8.36□□□□□ -1.07
NFI1Q12216 YHR219WYHR219W 1875 nt8.36□□□□□ -1.07
NFI1Q12216 PFS2YNL317W 1398 nt8.35□□□□□ -1.07
NFI1Q12216 ITR1YDR497C 1755 nt8.35□□□□□ -1.07
NFI1Q12216 RPT5YOR117W 1305 nt8.35□□□□□ -1.07
NFI1Q12216 MSB3YNL293W 1902 nt8.35□□□□□ -1.07
NFI1Q12216 STF1YDL130W-A 261 nt8.34□□□□□ -1.07
NFI1Q12216 OYE2YHR179W 1203 nt8.34□□□□□ -1.07
NFI1Q12216 YJL055WYJL055W 738 nt8.34□□□□□ -1.07
NFI1Q12216 YJL118WYJL118W 660 nt8.34□□□□□ -1.07
NFI1Q12216 ASP3-1YLR155C 1089 nt8.34□□□□□ -1.07
NFI1Q12216 ASP3-2YLR157C 1089 nt8.34□□□□□ -1.07
NFI1Q12216 ASP3-3YLR158C 1089 nt8.34□□□□□ -1.07
NFI1Q12216 ASP3-4YLR160C 1089 nt8.34□□□□□ -1.07
NFI1Q12216 GPN2YOR262W 1044 nt8.34□□□□□ -1.07
NFI1Q12216 EAF3YPR023C 1206 nt8.34□□□□□ -1.07
NFI1Q12216 snR4snR4 186 nt8.34□□□□□ -1.07
NFI1Q12216 YDR455CYDR455C 309 nt8.33□□□□□ -1.08
NFI1Q12216 YMR244WYMR244W 1068 nt8.33□□□□□ -1.08
NFI1Q12216 ATO2YNR002C 849 nt8.33□□□□□ -1.08
NFI1Q12216 YLR046CYLR046C 813 nt8.32□□□□□ -1.08
NFI1Q12216 YMR226CYMR226C 804 nt8.32□□□□□ -1.08
NFI1Q12216 LSB3YFR024C-A 1380 nt8.32□□□□□ -1.08
NFI1Q12216 TPS1YBR126C 1488 nt8.32□□□□□ -1.08
NFI1Q12216 HSV2YGR223C 1347 nt8.31□□□□□ -1.08
NFI1Q12216 VRG4YGL225W 1014 nt8.31□□□□□ -1.08
NFI1Q12216 DLD3YEL071W 1491 nt8.31□□□□□ -1.08
NFI1Q12216 ENT4YLL038C 744 nt8.3□□□□□ -1.08
NFI1Q12216 LSR1LSR1 1175 nt8.3□□□□□ -1.08
NFI1Q12216 HXT12YIL170W 1374 nt8.3□□□□□ -1.08
NFI1Q12216 HXT13YEL069C 1695 nt8.3□□□□□ -1.08
NFI1Q12216 YJR154WYJR154W 1041 nt8.29□□□□□ -1.08
NFI1Q12216 DDI1YER143W 1287 nt8.28□□□□□ -1.08
NFI1Q12216 ORT1YOR130C 879 nt8.28□□□□□ -1.08
NFI1Q12216 MAS2YHR024C 1449 nt8.28□□□□□ -1.08
NFI1Q12216 PRC1YMR297W 1599 nt8.27□□□□□ -1.09
NFI1Q12216 ITR2YOL103W 1830 nt8.27□□□□□ -1.09
NFI1Q12216 YNL040WYNL040W 1371 nt8.27□□□□□ -1.09
NFI1Q12216 CWP2YKL096W-A 279 nt8.26□□□□□ -1.09
NFI1Q12216 ATP10YLR393W 840 nt8.26□□□□□ -1.09
NFI1Q12216 ERG13YML126C 1476 nt8.26□□□□□ -1.09
NFI1Q12216 RIB2YOL066C 1776 nt8.25□□□□□ -1.09
NFI1Q12216 GAL3YDR009W 1563 nt8.24□□□□□ -1.09
NFI1Q12216 RPD3YNL330C 1302 nt8.24□□□□□ -1.09
NFI1Q12216 CDC13YDL220C 2775 nt8.23□□□□□ -1.09
NFI1Q12216 MET1YKR069W 1782 nt8.23□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 39.6 ms