Protein–RNA interactions for Protein: Q07912

TNK2, Activated CDC42 kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNK2Q07912 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNK2Q07912 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNK2Q07912 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNK2Q07912 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNK2Q07912 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNK2Q07912 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNK2Q07912 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNK2Q07912 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNK2Q07912 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNK2Q07912 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNK2Q07912 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TNK2Q07912 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNK2Q07912 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TNK2Q07912 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNK2Q07912 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNK2Q07912 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNK2Q07912 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNK2Q07912 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TNK2Q07912 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNK2Q07912 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNK2Q07912 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TNK2Q07912 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TNK2Q07912 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNK2Q07912 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNK2Q07912 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNK2Q07912 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNK2Q07912 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNK2Q07912 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNK2Q07912 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNK2Q07912 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNK2Q07912 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNK2Q07912 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TNK2Q07912 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TNK2Q07912 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TNK2Q07912 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNK2Q07912 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNK2Q07912 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNK2Q07912 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNK2Q07912 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TNK2Q07912 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNK2Q07912 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNK2Q07912 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNK2Q07912 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNK2Q07912 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TNK2Q07912 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNK2Q07912 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNK2Q07912 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNK2Q07912 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNK2Q07912 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNK2Q07912 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNK2Q07912 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TNK2Q07912 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNK2Q07912 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNK2Q07912 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNK2Q07912 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNK2Q07912 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNK2Q07912 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNK2Q07912 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNK2Q07912 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNK2Q07912 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNK2Q07912 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TNK2Q07912 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNK2Q07912 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNK2Q07912 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNK2Q07912 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNK2Q07912 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNK2Q07912 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNK2Q07912 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNK2Q07912 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNK2Q07912 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNK2Q07912 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNK2Q07912 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNK2Q07912 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNK2Q07912 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNK2Q07912 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNK2Q07912 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNK2Q07912 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNK2Q07912 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNK2Q07912 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNK2Q07912 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNK2Q07912 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNK2Q07912 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNK2Q07912 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNK2Q07912 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNK2Q07912 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNK2Q07912 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNK2Q07912 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNK2Q07912 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNK2Q07912 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNK2Q07912 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNK2Q07912 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNK2Q07912 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNK2Q07912 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNK2Q07912 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TNK2Q07912 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNK2Q07912 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNK2Q07912 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNK2Q07912 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNK2Q07912 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNK2Q07912 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms