Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPN11Q06124 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPN11Q06124 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPN11Q06124 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPN11Q06124 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPN11Q06124 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPN11Q06124 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPN11Q06124 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPN11Q06124 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPN11Q06124 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPN11Q06124 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPN11Q06124 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPN11Q06124 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPN11Q06124 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPN11Q06124 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPN11Q06124 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPN11Q06124 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPN11Q06124 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPN11Q06124 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPN11Q06124 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPN11Q06124 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPN11Q06124 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPN11Q06124 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPN11Q06124 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPN11Q06124 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPN11Q06124 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPN11Q06124 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPN11Q06124 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPN11Q06124 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPN11Q06124 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPN11Q06124 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPN11Q06124 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPN11Q06124 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPN11Q06124 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPN11Q06124 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPN11Q06124 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPN11Q06124 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPN11Q06124 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPN11Q06124 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPN11Q06124 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPN11Q06124 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPN11Q06124 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPN11Q06124 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPN11Q06124 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPN11Q06124 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPN11Q06124 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPN11Q06124 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPN11Q06124 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPN11Q06124 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPN11Q06124 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPN11Q06124 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPN11Q06124 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPN11Q06124 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPN11Q06124 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPN11Q06124 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPN11Q06124 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPN11Q06124 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPN11Q06124 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPN11Q06124 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPN11Q06124 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPN11Q06124 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPN11Q06124 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPN11Q06124 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPN11Q06124 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPN11Q06124 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPN11Q06124 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPN11Q06124 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPN11Q06124 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPN11Q06124 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPN11Q06124 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPN11Q06124 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPN11Q06124 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPN11Q06124 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPN11Q06124 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPN11Q06124 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPN11Q06124 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPN11Q06124 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPN11Q06124 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPN11Q06124 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPN11Q06124 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPN11Q06124 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPN11Q06124 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPN11Q06124 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPN11Q06124 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPN11Q06124 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPN11Q06124 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PTPN11Q06124 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPN11Q06124 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPN11Q06124 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPN11Q06124 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPN11Q06124 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPN11Q06124 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPN11Q06124 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPN11Q06124 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPN11Q06124 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPN11Q06124 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPN11Q06124 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPN11Q06124 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPN11Q06124 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPN11Q06124 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms