Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	Q04048	SWM1	YDR260C	513 nt		10.52	□□□□□ -0.73
SYF1	Q04048	SPE2	YOL052C	1191 nt		10.52	□□□□□ -0.73
SYF1	Q04048	SPP2	YOR148C	558 nt		10.52	□□□□□ -0.73
SYF1	Q04048	YDR455C	YDR455C	309 nt		10.51	□□□□□ -0.73
SYF1	Q04048	ADE8	YDR408C	645 nt		10.5	□□□□□ -0.73
SYF1	Q04048	FLX1	YIL134W	936 nt		10.5	□□□□□ -0.73
SYF1	Q04048	ABZ2	YMR289W	1125 nt		10.5	□□□□□ -0.73
SYF1	Q04048	TAT2	YOL020W	1779 nt		10.49	□□□□□ -0.73
SYF1	Q04048	YJL067W	YJL067W	351 nt		10.49	□□□□□ -0.73
SYF1	Q04048	RRT8	YOL048C	1029 nt		10.48	□□□□□ -0.73
SYF1	Q04048	THP3	YPR045C	1413 nt		10.47	□□□□□ -0.73
SYF1	Q04048	YMR007W	YMR007W	381 nt		10.46	□□□□□ -0.73
SYF1	Q04048	TVP23	YDR084C	600 nt		10.45	□□□□□ -0.74
SYF1	Q04048	CWC15	YDR163W	528 nt		10.44	□□□□□ -0.74
SYF1	Q04048	ASP3-1	YLR155C	1089 nt		10.44	□□□□□ -0.74
SYF1	Q04048	ASP3-2	YLR157C	1089 nt		10.44	□□□□□ -0.74
SYF1	Q04048	ASP3-3	YLR158C	1089 nt		10.44	□□□□□ -0.74
SYF1	Q04048	ASP3-4	YLR160C	1089 nt		10.44	□□□□□ -0.74
SYF1	Q04048	ADH3	YMR083W	1128 nt		10.44	□□□□□ -0.74
SYF1	Q04048	RCR1	YBR005W	642 nt		10.43	□□□□□ -0.74
SYF1	Q04048	ERG13	YML126C	1476 nt		10.42	□□□□□ -0.74
SYF1	Q04048	PHB2	YGR231C	933 nt		10.42	□□□□□ -0.74
SYF1	Q04048	MOB1	YIL106W	945 nt		10.42	□□□□□ -0.74
SYF1	Q04048	SER2	YGR208W	930 nt		10.41	□□□□□ -0.74
SYF1	Q04048	ENO2	YHR174W	1314 nt		10.39	□□□□□ -0.75
SYF1	Q04048	FRE6	YLL051C	2139 nt		10.39	□□□□□ -0.75
SYF1	Q04048	HSL7	YBR133C	2484 nt		10.39	□□□□□ -0.75
SYF1	Q04048	CYC3	YAL039C	810 nt		10.38	□□□□□ -0.75
SYF1	Q04048	FSH2	YMR222C	672 nt		10.38	□□□□□ -0.75
SYF1	Q04048	VPS62	YGR141W	1404 nt		10.38	□□□□□ -0.75
SYF1	Q04048	ACH1	YBL015W	1581 nt		10.37	□□□□□ -0.75
SYF1	Q04048	TPC1	YGR096W	945 nt		10.36	□□□□□ -0.75
SYF1	Q04048	OPI3	YJR073C	621 nt		10.36	□□□□□ -0.75
SYF1	Q04048	BET2	YPR176C	978 nt		10.36	□□□□□ -0.75
SYF1	Q04048	NAR1	YNL240C	1476 nt		10.35	□□□□□ -0.75
SYF1	Q04048	YOR343C	YOR343C	327 nt		10.34	□□□□□ -0.75
SYF1	Q04048	HTS1	YPR033C	1641 nt		10.33	□□□□□ -0.76
SYF1	Q04048	YKR012C	YKR012C	378 nt		10.32	□□□□□ -0.76
SYF1	Q04048	PAU21	YOR394W	495 nt		10.31	□□□□□ -0.76
SYF1	Q04048	PAU22	YPL282C	495 nt		10.31	□□□□□ -0.76
SYF1	Q04048	AMF1	YOR378W	1548 nt		10.31	□□□□□ -0.76
SYF1	Q04048	PCP1	YGR101W	1041 nt		10.3	□□□□□ -0.76
SYF1	Q04048	RDN25-1	RDN25-1	3396 nt		10.3	□□□□□ -0.76
SYF1	Q04048	RDN25-2	RDN25-2	3396 nt		10.3	□□□□□ -0.76
SYF1	Q04048	TGA1	tA(UGC)A	73 nt		10.29	□□□□□ -0.76
SYF1	Q04048	tA(UGC)E	tA(UGC)E	73 nt		10.29	□□□□□ -0.76
SYF1	Q04048	tA(UGC)G	tA(UGC)G	73 nt		10.29	□□□□□ -0.76
SYF1	Q04048	tA(UGC)L	tA(UGC)L	73 nt		10.29	□□□□□ -0.76
SYF1	Q04048	tA(UGC)O	tA(UGC)O	73 nt		10.29	□□□□□ -0.76
SYF1	Q04048	RPL12B	YDR418W	498 nt		10.29	□□□□□ -0.76
SYF1	Q04048	YDL086W	YDL086W	822 nt		10.28	□□□□□ -0.76
SYF1	Q04048	YAL016C-A	YAL016C-A	315 nt		10.28	□□□□□ -0.76
SYF1	Q04048	FCY1	YPR062W	477 nt		10.28	□□□□□ -0.76
SYF1	Q04048	DIG1	YPL049C	1359 nt		10.27	□□□□□ -0.76
SYF1	Q04048	HRA1	HRA1	564 nt		10.26	□□□□□ -0.77
SYF1	Q04048	GRH1	YDR517W	1119 nt		10.25	□□□□□ -0.77
SYF1	Q04048	YGR210C	YGR210C	1236 nt		10.25	□□□□□ -0.77
SYF1	Q04048	AIM1	YAL046C	357 nt		10.25	□□□□□ -0.77
SYF1	Q04048	LEU2	YCL018W	1095 nt		10.25	□□□□□ -0.77
SYF1	Q04048	LSB6	YJL100W	1824 nt		10.23	□□□□□ -0.77
SYF1	Q04048	SAC7	YDR389W	1965 nt		10.22	□□□□□ -0.77
SYF1	Q04048	YLR280C	YLR280C	351 nt		10.21	□□□□□ -0.77
SYF1	Q04048	ENO1	YGR254W	1314 nt		10.21	□□□□□ -0.78
SYF1	Q04048	SDS24	YBR214W	1584 nt		10.21	□□□□□ -0.78
SYF1	Q04048	ERO1	YML130C	1692 nt		10.2	□□□□□ -0.78
SYF1	Q04048	NAM8	YHR086W	1572 nt		10.19	□□□□□ -0.78
SYF1	Q04048	SRP102	YKL154W	735 nt		10.19	□□□□□ -0.78
SYF1	Q04048	YOR268C	YOR268C	399 nt		10.19	□□□□□ -0.78
SYF1	Q04048	PBP1	YGR178C	2169 nt		10.19	□□□□□ -0.78
SYF1	Q04048	YNR064C	YNR064C	873 nt		10.17	□□□□□ -0.78
SYF1	Q04048	EMC3	YKL207W	762 nt		10.16	□□□□□ -0.78
SYF1	Q04048	ENT4	YLL038C	744 nt		10.15	□□□□□ -0.78
SYF1	Q04048	CMP2	YML057W	1815 nt		10.13	□□□□□ -0.79
SYF1	Q04048	YIL100C-A	YIL100C-A	339 nt		10.13	□□□□□ -0.79
SYF1	Q04048	VBA3	YCL069W	1377 nt		10.13	□□□□□ -0.79
SYF1	Q04048	CYT2	YKL087C	675 nt		10.12	□□□□□ -0.79
SYF1	Q04048	YPL108W	YPL108W	507 nt		10.11	□□□□□ -0.79
SYF1	Q04048	YJL160C	YJL160C	864 nt		10.09	□□□□□ -0.79
SYF1	Q04048	ELO1	YJL196C	933 nt		10.09	□□□□□ -0.79
SYF1	Q04048	YLR046C	YLR046C	813 nt		10.09	□□□□□ -0.79
SYF1	Q04048	YMR210W	YMR210W	1350 nt		10.08	□□□□□ -0.8
SYF1	Q04048	KEL3	YPL263C	1956 nt		10.07	□□□□□ -0.8
SYF1	Q04048	MFG1	YDL233W	1377 nt		10.07	□□□□□ -0.8
SYF1	Q04048	MRP1	YDR347W	966 nt		10.07	□□□□□ -0.8
SYF1	Q04048	REX2	YLR059C	810 nt		10.07	□□□□□ -0.8
SYF1	Q04048	RIM2	YBR192W	1134 nt		10.07	□□□□□ -0.8
SYF1	Q04048	KAE1	YKR038C	1161 nt		10.05	□□□□□ -0.8
SYF1	Q04048	SWT21	YNL187W	1074 nt		10.05	□□□□□ -0.8
SYF1	Q04048	HEL2	YDR266C	1920 nt		10.05	□□□□□ -0.8
SYF1	Q04048	CCT2	YIL142W	1584 nt		10.05	□□□□□ -0.8
SYF1	Q04048	INA1	YLR413W	2028 nt		10.03	□□□□□ -0.8
SYF1	Q04048	SFL1	YOR140W	2301 nt		10.02	□□□□□ -0.8
SYF1	Q04048	YKL053W	YKL053W	375 nt		10.02	□□□□□ -0.81
SYF1	Q04048	YOR325W	YOR325W	474 nt		10.02	□□□□□ -0.81
SYF1	Q04048	MET1	YKR069W	1782 nt		10.01	□□□□□ -0.81
SYF1	Q04048	SRP54	YPR088C	1626 nt		10	□□□□□ -0.81
SYF1	Q04048	EDC2	YER035W	438 nt		9.99	□□□□□ -0.81
SYF1	Q04048	LSP1	YPL004C	1026 nt		9.99	□□□□□ -0.81
SYF1	Q04048	HOG1	YLR113W	1308 nt		9.99	□□□□□ -0.81
SYF1	Q04048	YFR020W	YFR020W	699 nt		9.98	□□□□□ -0.81

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