Protein–RNA interactions for Protein: Q03938

ZNF90, Zinc finger protein 90, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF90Q03938 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF90Q03938 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF90Q03938 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF90Q03938 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF90Q03938 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF90Q03938 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF90Q03938 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF90Q03938 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF90Q03938 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF90Q03938 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF90Q03938 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF90Q03938 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF90Q03938 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF90Q03938 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF90Q03938 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF90Q03938 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF90Q03938 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF90Q03938 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF90Q03938 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZNF90Q03938 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF90Q03938 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF90Q03938 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF90Q03938 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF90Q03938 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF90Q03938 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF90Q03938 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF90Q03938 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF90Q03938 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF90Q03938 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF90Q03938 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF90Q03938 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF90Q03938 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF90Q03938 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF90Q03938 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF90Q03938 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF90Q03938 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF90Q03938 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF90Q03938 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF90Q03938 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF90Q03938 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF90Q03938 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF90Q03938 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF90Q03938 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF90Q03938 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF90Q03938 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF90Q03938 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF90Q03938 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF90Q03938 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF90Q03938 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF90Q03938 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF90Q03938 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF90Q03938 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF90Q03938 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF90Q03938 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF90Q03938 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF90Q03938 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF90Q03938 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF90Q03938 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF90Q03938 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF90Q03938 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF90Q03938 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF90Q03938 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF90Q03938 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF90Q03938 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF90Q03938 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF90Q03938 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF90Q03938 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF90Q03938 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF90Q03938 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF90Q03938 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF90Q03938 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF90Q03938 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF90Q03938 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF90Q03938 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF90Q03938 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF90Q03938 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF90Q03938 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF90Q03938 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF90Q03938 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF90Q03938 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF90Q03938 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF90Q03938 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF90Q03938 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF90Q03938 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF90Q03938 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF90Q03938 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF90Q03938 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF90Q03938 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF90Q03938 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF90Q03938 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF90Q03938 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF90Q03938 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF90Q03938 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF90Q03938 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF90Q03938 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF90Q03938 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF90Q03938 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF90Q03938 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF90Q03938 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF90Q03938 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms