Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFHR1Q03591 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFHR1Q03591 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFHR1Q03591 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFHR1Q03591 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFHR1Q03591 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFHR1Q03591 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFHR1Q03591 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFHR1Q03591 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFHR1Q03591 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFHR1Q03591 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFHR1Q03591 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFHR1Q03591 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFHR1Q03591 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFHR1Q03591 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFHR1Q03591 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFHR1Q03591 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFHR1Q03591 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFHR1Q03591 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CFHR1Q03591 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CFHR1Q03591 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CFHR1Q03591 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CFHR1Q03591 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CFHR1Q03591 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CFHR1Q03591 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFHR1Q03591 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFHR1Q03591 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFHR1Q03591 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFHR1Q03591 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFHR1Q03591 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFHR1Q03591 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFHR1Q03591 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFHR1Q03591 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFHR1Q03591 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CFHR1Q03591 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFHR1Q03591 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFHR1Q03591 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFHR1Q03591 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFHR1Q03591 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFHR1Q03591 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFHR1Q03591 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFHR1Q03591 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CFHR1Q03591 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CFHR1Q03591 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFHR1Q03591 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFHR1Q03591 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFHR1Q03591 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFHR1Q03591 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFHR1Q03591 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFHR1Q03591 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFHR1Q03591 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFHR1Q03591 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFHR1Q03591 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFHR1Q03591 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFHR1Q03591 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFHR1Q03591 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CFHR1Q03591 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFHR1Q03591 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFHR1Q03591 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFHR1Q03591 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFHR1Q03591 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFHR1Q03591 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFHR1Q03591 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFHR1Q03591 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFHR1Q03591 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFHR1Q03591 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFHR1Q03591 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFHR1Q03591 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFHR1Q03591 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFHR1Q03591 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFHR1Q03591 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFHR1Q03591 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFHR1Q03591 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFHR1Q03591 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFHR1Q03591 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFHR1Q03591 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFHR1Q03591 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFHR1Q03591 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFHR1Q03591 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFHR1Q03591 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFHR1Q03591 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFHR1Q03591 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CFHR1Q03591 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CFHR1Q03591 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CFHR1Q03591 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CFHR1Q03591 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CFHR1Q03591 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CFHR1Q03591 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CFHR1Q03591 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CFHR1Q03591 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CFHR1Q03591 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFHR1Q03591 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFHR1Q03591 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFHR1Q03591 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFHR1Q03591 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFHR1Q03591 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFHR1Q03591 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFHR1Q03591 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFHR1Q03591 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFHR1Q03591 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms